Zu den chemischen Inhibitoren von PAPD4 gehören eine Reihe von Verbindungen, die die enzymatische Funktion des Anhängens von Poly(A)-Schwänzen an die RNA behindern. Cordycepin oder 3'-Deoxyadenosin ahmt die Struktur von Adenosin nach und wird während der Polyadenylierung in die RNA-Kette eingebaut. Einmal eingebaut, beendet es den Prozess vorzeitig und hemmt so direkt die Aktivität von PAPD4. Flavopiridol, ein bekannter Inhibitor von Cyclin-abhängigen Kinasen, könnte indirekt auf PAPD4 einwirken, indem es die Transkriptionsumgebung moduliert. Diese Veränderung könnte die Effizienz oder das Auftreten der Polyadenylierung verringern.
Eine weitere indirekte Hemmung kann von Chemikalien ausgehen, die die Transkription und die RNA-Verarbeitung beeinflussen. Alpha-Amanitin hemmt spezifisch die RNA-Polymerase II und verringert dadurch den Pool an neuer RNA, die der Polyadenylierung durch PAPD4 unterzogen werden könnte. In ähnlicher Weise interkalieren Actinomycin D und Ellipticin in die DNA, verhindern die RNA-Synthese und hemmen somit indirekt PAPD4 durch Verringerung der Substratverfügbarkeit. Leptomycin B kann durch die Hemmung des Kernexports eine Anhäufung von RNA-bindenden Proteinen im Zellkern verursachen, was die für die Funktion von PAPD4 erforderlichen Prozesse stören könnte. DRB und Triptolide führen durch ihre Hemmung der Transkriptionsverlängerung zu einer verringerten Synthese von RNA-Substraten für PAPD4 und hemmen damit indirekt dessen Aktivität. Roscovitin, ein weiterer CDK-Inhibitor, könnte PAPD4 hemmen, indem er den Phosphorylierungsstatus von Proteinen verändert, die am Polyadenylierungsprozess beteiligt sind. BX-795 schließlich hemmt PDK1, was sich möglicherweise auf die Phosphorylierung nachgeschalteter Zielproteine und folglich auf die RNA-Verarbeitungsaktivitäten auswirkt, an denen PAPD4 beteiligt ist. Jede dieser Chemikalien trägt durch ihre jeweiligen Mechanismen zur Hemmung von PAPD4 bei, was das komplexe Zusammenspiel zwischen Transkription, RNA-Verarbeitung und Polyadenylierung unterstreicht.
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| Produkt | CAS # | Katalog # | Menge | Preis | Referenzen | Bewertung |
|---|---|---|---|---|---|---|
Cordycepin | 73-03-0 | sc-203902 | 10 mg | $99.00 | 5 | |
Cordycepin kann aufgrund seiner strukturellen Ähnlichkeit mit Adenosin von PAPD4 anstelle von ATP eingebaut werden, wodurch der Polyadenylierungsprozess vorzeitig beendet wird. | ||||||
Flavopiridol Hydrochloride | 131740-09-5 | sc-207687 | 10 mg | $311.00 | ||
Flavopiridol hemmt verschiedene Cyclin-abhängige Kinasen (CDKs), die möglicherweise an der Regulation der Transkription beteiligt sind und indirekt PAPD4 hemmen könnten, indem sie die für seine Funktion notwendige zelluläre Umgebung verändern. | ||||||
α-Amanitin | 23109-05-9 | sc-202440 sc-202440A | 1 mg 5 mg | $260.00 $1029.00 | 26 | |
Alpha-Amanitin hemmt die RNA-Polymerase II, die möglicherweise indirekt PAPD4 hemmt, indem sie die Verfügbarkeit von RNA-Substraten für die Polyadenylierung verringert. | ||||||
Betulinic Acid | 472-15-1 | sc-200132 sc-200132A | 25 mg 100 mg | $115.00 $337.00 | 3 | |
Betulinsäure kann Veränderungen in der zellulären Lokalisation und Phosphorylierung von Proteinen hervorrufen. Sie kann indirekt PAPD4 hemmen, indem sie dessen Phosphorylierungszustand oder dessen Interaktion mit notwendigen Kofaktoren verändert. | ||||||
Ellipticine | 519-23-3 | sc-200878 sc-200878A | 10 mg 50 mg | $142.00 $558.00 | 4 | |
Als Interkalationsmittel kann Ellipticin an die DNA binden und möglicherweise indirekt PAPD4 hemmen, indem es die Transkription der für die Polyadenylierung erforderlichen RNA-Substrate verhindert. | ||||||
Leptomycin B | 87081-35-4 | sc-358688 sc-358688A sc-358688B | 50 µg 500 µg 2.5 mg | $105.00 $408.00 $1224.00 | 35 | |
Leptomycin B hemmt den Kernexport durch Bindung an Exportin 1 (CRM1), was möglicherweise zur Anhäufung von RNA-Bindungsproteinen im Zellkern und zur indirekten Hemmung von PAPD4 aufgrund einer veränderten RNA-Verarbeitung führt. | ||||||
DRB | 53-85-0 | sc-200581 sc-200581A sc-200581B sc-200581C | 10 mg 50 mg 100 mg 250 mg | $42.00 $185.00 $310.00 $650.00 | 6 | |
DRB hemmt CDK9 und beeinträchtigt dadurch die Verlängerung der Transkription. Die Funktion von PAPD4 könnte indirekt durch eine verminderte Synthese von RNA-Substraten gehemmt werden. | ||||||
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
Durch die Interkalation in die DNA hemmt Actinomycin D die Transkription und reduziert so indirekt die Verfügbarkeit von RNA-Substraten für PAPD4 und hemmt so dessen Funktion. | ||||||
Triptolide | 38748-32-2 | sc-200122 sc-200122A | 1 mg 5 mg | $88.00 $200.00 | 13 | |
Triptolid hemmt die Transkription mehrerer Gene, indem es die Aktivität der RNA-Polymerase II beeinträchtigt und indirekt PAPD4 hemmt, indem es den Pool der für die Polyadenylierung verfügbaren RNA-Substrate verringert. | ||||||
Roscovitine | 186692-46-6 | sc-24002 sc-24002A | 1 mg 5 mg | $92.00 $260.00 | 42 | |
Roscovitin ist ein CDK-Inhibitor, und durch die Hemmung von CDKs kann es den Phosphorylierungszustand von Proteinen verändern, die für die PAPD4-Funktion notwendig sind, oder indirekt PAPD4 hemmen, indem es den Transkriptionsprozess beeinflusst. | ||||||