PCDHA12阻害剤は、より大きなカドヘリン・スーパーファミリーに属するプロトカドヘリンα遺伝子クラスターのメンバーであるPCDHA12に選択的に結合し、その活性を阻害するように設計された化学物質群である。プロトカドヘリンは、カルシウム依存性の細胞間接着に関与する膜タンパク質で、神経細胞の特異的な結合に寄与することにより、神経系の発達と機能において極めて重要な役割を果たしている。PCDHA12は、そのユニークな細胞外ドメインによって特徴付けられ、ホモフィリック相互作用-隣接する細胞上の同一ドメインとの結合-に関与することで、特異的な細胞接着事象を促進する。PCDHA12を標的とする阻害剤は、結合部位を占有したり、タンパク質のコンフォメーションを変化させたりすることによって、このようなホモフィリック相互作用を阻害し、それによってPCDHA12を発現する細胞の接着特性を変化させる。このような阻害剤の発見には、PCDHA12の構造、特にその接着ドメインの包括的な理解と、他のプロトカドヘリンや細胞接着分子に影響を与えることなく、その接着能力を効果的に阻害できる化合物の同定が必要である。
PCDHA12阻害剤を同定するプロセスは、通常、PCDHA12を介する細胞接着を阻害する能力を示す化合物を見つけるための化学ライブラリーのスクリーニングから始まる。このスクリーニングには、通常PCDHA12依存性の相互作用を促進するような条件下での細胞凝集アッセイや細胞接着アッセイなど、PCDHA12の機能阻害を検出するためにデザインされた様々なアッセイが含まれる。これらのスクリーニングから得られたヒット化合物は、PCDHA12の接着メカニズムを特異的に標的とすることが期待される分子である。これらの化合物は、プロトカドヘリンファミリーの他のメンバーや無関係な細胞接着分子を無差別に阻害しないことを確認するために、特異性を確認する一連のバリデーションテストを受けることになる。競合結合アッセイ(分子がPCDHA12とリガンドへの結合を競合する能力をテストする)のような技術や、表面プラズモン共鳴(SPR)のような生物物理学的アッセイが、これらの潜在的な阻害剤の特性を明らかにするために重要であろう。
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| 製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
|---|---|---|---|---|---|---|
5-Aza-2′-Deoxycytidine | 2353-33-5 | sc-202424 sc-202424A sc-202424B | 25 mg 100 mg 250 mg | $214.00 $316.00 $418.00 | 7 | |
デシタビンはDNAメチル化酵素阻害剤であり、DNAメチル化を減少させ、プロモーター領域が影響を受けた場合、PCDHA12の発現を減少させる可能性がある。 | ||||||
Suberoylanilide Hydroxamic Acid | 149647-78-9 | sc-220139 sc-220139A | 100 mg 500 mg | $130.00 $270.00 | 37 | |
ボリノスタット(SAHA)はHDAC阻害剤で、ヒストンのアセチル化を変化させ、クロマチンリモデリングを通じてPCDHA12の発現を低下させる可能性がある。 | ||||||
RG 108 | 48208-26-0 | sc-204235 sc-204235A | 10 mg 50 mg | $128.00 $505.00 | 2 | |
RG108はDNAメチル化酵素阻害剤であり、PCDHA12プロモーターを脱メチル化し、遺伝子サイレンシングを引き起こす可能性がある。 | ||||||
Mithramycin A | 18378-89-7 | sc-200909 | 1 mg | $54.00 | 6 | |
ミトラマイシンAはDNAと結合し、転写因子の結合を阻害し、PCDHA12のような遺伝子の発現を低下させる可能性がある。 | ||||||
Trichostatin A | 58880-19-6 | sc-3511 sc-3511A sc-3511B sc-3511C sc-3511D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 50 mg | $149.00 $470.00 $620.00 $1199.00 $2090.00 | 33 | |
トリコスタチンAはHDAC阻害剤で、クロマチンアクセシビリティを変化させることにより、PCDHA12を含む遺伝子の発現を広く抑制することができる。 | ||||||
5-Azacytidine | 320-67-2 | sc-221003 | 500 mg | $280.00 | 4 | |
このDNAメチル化酵素阻害剤はDNAメチル化パターンに影響を与え、PCDHA12の転写制御に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
アクチノマイシンDはDNAにインターカレートしてRNAポリメラーゼを阻害し、PCDHA12の転写を低下させる可能性がある。 | ||||||
Disulfiram | 97-77-8 | sc-205654 sc-205654A | 50 g 100 g | $52.00 $87.00 | 7 | |
ジスルフィラムはヒストンのアセチル化とメチル化に影響を与え、PCDHA12の発現プロファイルに変化をもたらす可能性がある。 | ||||||
MS-275 | 209783-80-2 | sc-279455 sc-279455A sc-279455B | 1 mg 5 mg 25 mg | $24.00 $88.00 $208.00 | 24 | |
エンチノスタットはHDAC阻害剤であり、クロマチン構造を変化させ、PCDHA12のような遺伝子の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Parthenolide | 20554-84-1 | sc-3523 sc-3523A | 50 mg 250 mg | $79.00 $300.00 | 32 | |
パルテノライドは、NF-κBシグナル伝達に対する作用を通して遺伝子発現を調節し、おそらくPCDHA12の発現に影響を及ぼすと考えられる。 | ||||||