Nel caso in cui la proteina codificata da C3orf60 sia di interesse scientifico, e supponendo che si tratti di un enzima o di un recettore con una funzione biologica significativa, gli studi iniziali si concentrerebbero sulla determinazione della sua struttura tridimensionale e dei meccanismi d'azione. Tale ricerca potrebbe impiegare metodologie come la cristallografia a raggi X, la microscopia crioelettronica o la spettroscopia di risonanza magnetica nucleare per tracciare la struttura della proteina a livello atomico. La comprensione delle complessità strutturali, compreso il sito attivo o le tasche di legame, è fondamentale per identificare le molecole che potrebbero interagire e inibire la funzione della proteina. Una volta acquisiti questi dettagli, la ricerca di potenziali inibitori inizia in genere con lo screening di librerie chimiche per scoprire i composti che mostrano affinità per la proteina, seguito da cicli iterativi di perfezionamento basati sui principi della chimica medicinale e della progettazione di farmaci basati sulla struttura.
Dopo l'identificazione dei composti guida iniziali, la fase successiva prevede l'ottimizzazione per migliorare le caratteristiche di legame e la specificità per la proteina C3orf60. Gli studi sulla relazione struttura-attività (SAR) sarebbero strumentali in questo processo, guidando la modifica chimica delle molecole guida per aumentarne la potenza e la selettività. Ogni iterazione prevedeva la sintesi di analoghi dei composti guida, seguita da test per valutare la loro interazione con la proteina. Attraverso questo processo meticoloso, si potrebbe ottenere una serie di composti, ciascuno con caratteristiche sempre migliori. Inoltre, le tecniche di chimica computazionale, come il docking molecolare e le simulazioni di dinamica, potrebbero prevedere come i cambiamenti nella struttura chimica potrebbero influire sull'interazione con la proteina, informando così la progettazione di inibitori più efficaci. L'obiettivo finale di questa ricerca sarebbe quello di sviluppare una collezione di strumenti molecolari per sondare la funzione del prodotto proteico di C3orf60, approfondendo così la comprensione del suo ruolo all'interno della cellula.
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Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
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Doxorubicin | 23214-92-8 | sc-280681 sc-280681A | 1 mg 5 mg | $173.00 $418.00 | 43 | |
Un'antraciclina che si intercala nel DNA, influenzando potenzialmente la trascrizione di vari geni, tra cui NDUFAF3. | ||||||
Rotenone | 83-79-4 | sc-203242 sc-203242A | 1 g 5 g | $89.00 $254.00 | 41 | |
Un pesticida che inibisce il Complesso I mitocondriale, riducendo potenzialmente la funzione mitocondriale e influenzando l'espressione delle proteine correlate. | ||||||
Chloramphenicol | 56-75-7 | sc-3594 | 25 g | $53.00 | 10 | |
È un antibiotico che inibisce la sintesi proteica mitocondriale, il che potrebbe influire indirettamente sull'assemblaggio dei complessi mitocondriali. | ||||||
Antimycin A | 1397-94-0 | sc-202467 sc-202467A sc-202467B sc-202467C | 5 mg 10 mg 1 g 3 g | $54.00 $62.00 $1642.00 $4600.00 | 51 | |
Inibisce il Complesso III della catena di trasporto degli elettroni, il che potrebbe alterare la funzione mitocondriale complessiva, con possibile impatto sull'espressione di NDUFAF3. | ||||||
Oligomycin | 1404-19-9 | sc-203342 sc-203342C | 10 mg 1 g | $146.00 $12250.00 | 18 | |
Un inibitore dell'ATP sintasi nella membrana mitocondriale, che potrebbe alterare la biogenesi mitocondriale e l'espressione delle proteine. | ||||||
Tetracycline | 60-54-8 | sc-205858 sc-205858A sc-205858B sc-205858C sc-205858D | 10 g 25 g 100 g 500 g 1 kg | $62.00 $92.00 $265.00 $409.00 $622.00 | 6 | |
Un antibiotico che può inibire la sintesi proteica mitocondriale ad alte concentrazioni, influenzando potenzialmente i livelli di NDUFAF3. | ||||||
Paraquat chloride | 1910-42-5 | sc-257968 | 250 mg | $149.00 | 7 | |
Crea stress ossidativo, che potrebbe danneggiare il DNA mitocondriale e le proteine, con possibili effetti sull'espressione di proteine come NDUFAF3. | ||||||
Actinonin | 13434-13-4 | sc-201289 sc-201289B | 5 mg 10 mg | $160.00 $319.00 | 3 | |
Un antibiotico peptidico che inibisce l'aminopeptidasi P, che potrebbe influenzare indirettamente i processi mitocondriali e l'espressione delle proteine. | ||||||
3′-Azido-3′-deoxythymidine | 30516-87-1 | sc-203319 | 10 mg | $60.00 | 2 | |
Un inibitore nucleosidico della trascrittasi inversa che può causare tossicità mitocondriale, influenzando potenzialmente l'espressione delle proteine mitocondriali. | ||||||
Ethidium bromide | 1239-45-8 | sc-203735 sc-203735A sc-203735B sc-203735C | 1 g 5 g 25 g 100 g | $47.00 $147.00 $576.00 $2045.00 | 12 | |
Si intercalano nel DNA e possono causare la deplezione del mtDNA, influenzando potenzialmente l'espressione delle proteine mitocondriali. |