La denominazione di attivatori del cluster istone 2 H3A si riferisce a una classe concettuale di molecole che interagiscono con una particolare variante della proteina istone H3 che, ai fini della presente descrizione, chiameremo H3A. L'istone H3 è un componente cruciale del nucleo dell'ottamero istonico, attorno al quale si avvolge il DNA per formare i nucleosomi, le unità strutturali della cromatina. La variante H3A presumibilmente presenta specifiche variazioni di sequenza o modifiche post-traduzionali che conferiscono proprietà uniche che la distinguono dalle altre varianti di H3. Gli attivatori di H3A sarebbero composti ingegnerizzati per legarsi selettivamente a questa variante, modificando così la sua funzione all'interno del nucleosoma. Tali modifiche potrebbero influenzare l'interazione tra la variante H3A e il DNA o altre proteine istoniche, con un potenziale impatto sulla stabilità del nucleosoma e sull'accessibilità della struttura cromatinica. Questo, a sua volta, potrebbe influenzare l'organizzazione della cromatina e la sua risposta ai vari segnali cellulari che regolano i modelli di espressione genica.
Il processo di identificazione e caratterizzazione degli attivatori H3A comporterebbe una sofisticata interazione tra sintesi chimica e sviluppo di saggi biologici. Le librerie chimiche, potenzialmente contenenti da migliaia a milioni di composti, verrebbero vagliate metodicamente per trovare quelli con un'elevata affinità per la variante H3A. Tecniche di screening avanzate, che potrebbero includere saggi basati sulla spettrometria di massa o sulla risonanza plasmonica di superficie, potrebbero essere applicate per rilevare e quantificare l'interazione tra H3A e potenziali attivatori. Una volta identificate le molecole che sembrano interagire con l'H3A, si procederebbe con analisi strutturali dettagliate. Tecniche come la cristallografia a raggi X, la crio-EM o la spettroscopia NMR potrebbero essere utilizzate per ottenere immagini ad alta risoluzione della variante H3A legata all'attivatore, facendo luce sull'interfaccia di legame e sulle interazioni molecolari. A complemento degli studi strutturali, i saggi funzionali potrebbero valutare l'impatto di questi attivatori sull'assemblaggio dei nucleosomi e sulla compattazione delle fibre di cromatina. La ricostituzione in vitro dei nucleosomi utilizzando istoni e DNA ricombinanti consentirebbe di valutare come gli attivatori H3A alterino le proprietà fisiche dei nucleosomi. Inoltre, approcci genomici, come il ChIP-seq, fornirebbero informazioni sulla distribuzione e sulla funzione in vivo della variante H3A all'interno della cromatina in diverse regioni del genoma, contribuendo a chiarire le conseguenze più ampie dell'attivazione di H3A sulla dinamica e sull'organizzazione della cromatina.
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| Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
|---|---|---|---|---|---|---|
Suberoylanilide Hydroxamic Acid | 149647-78-9 | sc-220139 sc-220139A | 100 mg 500 mg | $130.00 $270.00 | 37 | |
Un inibitore di HDAC che aumenta l'acetilazione degli istoni, portando potenzialmente a una struttura aperta della cromatina e all'upregolazione di vari geni, compresi quelli istonici. | ||||||
BIX01294 hydrochloride | 1392399-03-9 | sc-293525 sc-293525A sc-293525B | 1 mg 5 mg 25 mg | $36.00 $110.00 $400.00 | ||
Inibitore dell'istone metiltransferasi G9a che può alterare la metilazione degli istoni, influenzando potenzialmente l'espressione dei geni istonici. | ||||||
RG 108 | 48208-26-0 | sc-204235 sc-204235A | 10 mg 50 mg | $128.00 $505.00 | 2 | |
Un inibitore della DNA metiltransferasi che può portare alla demetilazione del DNA, influenzando potenzialmente l'espressione di vari geni, compresi gli istoni. | ||||||
Ademetionine | 29908-03-0 | sc-278677 sc-278677A | 100 mg 1 g | $180.00 $655.00 | 2 | |
Serve come donatore di metile in numerose reazioni di metilazione, tra cui la metilazione del DNA e degli istoni, che potrebbe potenzialmente regolare l'espressione genica. | ||||||
Valproic Acid | 99-66-1 | sc-213144 | 10 g | $85.00 | 9 | |
Un altro inibitore HDAC che può aumentare l'acetilazione degli istoni e potenzialmente influenzare l'espressione genica. | ||||||
5-Aza-2′-Deoxycytidine | 2353-33-5 | sc-202424 sc-202424A sc-202424B | 25 mg 100 mg 250 mg | $214.00 $316.00 $418.00 | 7 | |
Un analogo della citidina che inibisce la metilazione del DNA, portando potenzialmente a un aumento dell'espressione genica, compresa quella dei geni istone. | ||||||
Parthenolide | 20554-84-1 | sc-3523 sc-3523A | 50 mg 250 mg | $79.00 $300.00 | 32 | |
Può inibire la via NF-kB, determinando cambiamenti nell'espressione di vari geni, compresi eventualmente quelli che codificano per gli istoni. | ||||||
D,L-Sulforaphane | 4478-93-7 | sc-207495A sc-207495B sc-207495C sc-207495 sc-207495E sc-207495D | 5 mg 10 mg 25 mg 1 g 10 g 250 mg | $150.00 $286.00 $479.00 $1299.00 $8299.00 $915.00 | 22 | |
Si ritiene che abbia un'attività di inibitore dell'istone deacetilasi, che potrebbe potenzialmente influenzare l'espressione genica, compresi i geni istonici. | ||||||
Phenethyl isothiocyanate | 2257-09-2 | sc-205801 sc-205801A | 5 g 10 g | $102.00 $179.00 | 2 | |
L'isotiocianato di fenile (PEITC) è noto per la sua capacità di modulare le istone deacetilasi, che potrebbe influenzare l'espressione degli istoni e di altri geni. | ||||||
Resveratrol | 501-36-0 | sc-200808 sc-200808A sc-200808B | 100 mg 500 mg 5 g | $60.00 $185.00 $365.00 | 64 | |
È stato dimostrato che influenza l'attività della sirtuina e l'acetilazione degli istoni, influenzando potenzialmente i modelli di espressione genica. | ||||||