Im weiten Feld der zellulären DNA-Reparatur spielt die PNK (Polynukleotid-Kinase) eine zentrale Rolle, indem sie die zerbrochenen DNA-Fragmente überbrückt und so die Wiederherstellung der Genomintegrität erleichtert. Eine Reihe von Chemikalien spielt eine entscheidende Rolle bei der Modulation des Umfelds, in dem PNK arbeitet, wobei einige einen direkteren Einfluss haben als andere. ATP, die molekulare Währungseinheit für den Energietransfer innerhalb von Zellen, spielt eine unverzichtbare Rolle bei der Ausübung der Kinasefunktion von PNK. Ohne die Phosphatgruppen von ATP ist PNK nicht in der Lage, die 5'-Hydroxyl-Termini der DNA zu phosphorylieren, ein entscheidender Schritt vor der DNA-Ligation.
Aus einer umfassenderen Perspektive betrachtet, lösen andere Chemikalien DNA-Schäden aus oder stören Reparaturmechanismen, wodurch PNK ungewollt in Aktion tritt. Nehmen wir zum Beispiel Zeocin, Camptothecin und Etoposid. Auch wenn sie in erster Linie auf unterschiedliche zelluläre Strukturen oder Enzyme abzielen, kommt es in der Folge immer zu DNA-Schäden, die PNK auf den Plan rufen. Indirekt beeinflussen Substanzen wie NAD+ und Phosphatidylinositol auf subtile Weise die DNA-Reparaturlandschaft, indem sie damit verbundene Wege oder Enzyme modulieren, was indirekt die Bedeutung von PNK hervorhebt. Anhand dieser Chemikalien kann man das empfindliche Gleichgewicht und die komplizierte Choreografie hinter der DNA-Reparatur und die zentrale Rolle von PNK darin erkennen.
Produkt | CAS # | Katalog # | Menge | Preis | Referenzen | Bewertung |
---|---|---|---|---|---|---|
Adenosine 5′-Triphosphate, disodium salt | 987-65-5 | sc-202040 sc-202040A | 1 g 5 g | $38.00 $74.00 | 9 | |
ATP liefert die Phosphatgruppen, die für die Kinaseaktivität von PNK unerlässlich sind. Ohne ATP kann PNK die Phosphorylierung der 5'-Hydroxyltermini der DNA nicht ermöglichen, was für die anschließende DNA-Ligation von entscheidender Bedeutung ist. | ||||||
Caffeine | 58-08-2 | sc-202514 sc-202514A sc-202514B sc-202514C sc-202514D | 5 g 100 g 250 g 1 kg 5 kg | $32.00 $66.00 $95.00 $188.00 $760.00 | 13 | |
Koffein ist ein Alkylierungsmittel, das die DNA-Reparaturmechanismen stören kann. Diese Störung bedeutet, dass ein erhöhter Bedarf an Reparaturprozessen besteht, bei denen PNK eine Rolle spielt, wodurch indirekt seine Aktivität gesteigert wird. | ||||||
Chloroquine Sulphate | 132-73-0 | sc-337629 | 25 mg | $224.00 | 2 | |
Es ist bekannt, dass Chloroquin in die DNA eindringt und ihre reguläre Struktur stört. Diese Störung kann zu Fehlern bei der Replikation führen, wodurch der Bedarf an Reparaturenzymen wie PNK zur Behebung dieser Unregelmäßigkeiten steigt. | ||||||
Camptothecin | 7689-03-4 | sc-200871 sc-200871A sc-200871B | 50 mg 250 mg 100 mg | $57.00 $182.00 $92.00 | 21 | |
Camptothecin greift die DNA-Topoisomerase I an und hemmt sie, was zu DNA-Brüchen führt. Diese Brüche wiederum erhöhen den Bedarf an PNKs Kinase- und Phosphataseaktivitäten während der Reparaturprozesse. | ||||||
Etoposide (VP-16) | 33419-42-0 | sc-3512B sc-3512 sc-3512A | 10 mg 100 mg 500 mg | $32.00 $170.00 $385.00 | 63 | |
Etoposid bildet einen ternären Komplex mit der DNA und der Topoisomerase II, was zu DNA-Strangbrüchen führt. Dies erhöht die Notwendigkeit der Beteiligung von PNK an der Vorbereitung der gebrochenen Enden für die Ligation. | ||||||
NAD+, Free Acid | 53-84-9 | sc-208084B sc-208084 sc-208084A sc-208084C sc-208084D sc-208084E sc-208084F | 1 g 5 g 10 g 25 g 100 g 1 kg 5 kg | $56.00 $186.00 $296.00 $655.00 $2550.00 $3500.00 $10500.00 | 4 | |
NAD+ ist für die Aktivität von PARP-1, einem Enzym, das an der Reparatur von Einzelstrangbrüchen beteiligt ist, von entscheidender Bedeutung. Mit fortschreitender Reparatur wird die Rolle von Enzymen wie PNK immer wichtiger, wodurch NAD+ indirekt an Einfluss gewinnt. | ||||||
Staurosporine | 62996-74-1 | sc-3510 sc-3510A sc-3510B | 100 µg 1 mg 5 mg | $82.00 $150.00 $388.00 | 113 | |
Staurosporin ist ein potenter Kinase-Inhibitor, der mehrere Signalwege beeinflussen kann. Seine Fähigkeit, Phosphorylierungszustände bei zahlreichen Enzymen zu verändern, kann indirekt die Aktivität oder den Bedarf an PNK modulieren. | ||||||
Calyculin A | 101932-71-2 | sc-24000 sc-24000A sc-24000B sc-24000C | 10 µg 100 µg 500 µg 1 mg | $160.00 $750.00 $1400.00 $3000.00 | 59 | |
Calyculin A hemmt Proteinphosphatasen. Durch seine Wirkung kann das Gleichgewicht zwischen Phosphorylierung und Dephosphorylierung gestört werden, was sich auf Signalwege auswirken kann, bei denen PNK eine zentrale Rolle spielt. | ||||||
Pyridoxine Hydrochloride | 58-56-0 | sc-219674 | 10 mg | $41.00 | ||
Derivate von Phosphatidylinositol spielen eine zentrale Rolle in Signalwegen, die mit Wachstum und Reparatur zusammenhängen. Eine Veränderung dieser Signalwege kann zu einer erhöhten Nachfrage oder Modulation der PNK-Aktivität führen. | ||||||
Roscovitine | 186692-46-6 | sc-24002 sc-24002A | 1 mg 5 mg | $92.00 $260.00 | 42 | |
Roscovitin zielt auf Cyclin-abhängige Kinasen ab und beeinflusst den Zellzyklus. Veränderungen im Zellzyklus können indirekt den Bedarf oder die Verfügbarkeit von Reparaturenzymen wie PNK während der DNA-Schadensreaktion bestimmen. |