DsRed Inhibitoren

Gängige DsRed Inhibitors sind unter underem Actinomycin D CAS 50-76-0, Cycloheximide CAS 66-81-9, α-Amanitin CAS 23109-05-9, Fluorouracil CAS 51-21-8 und Rifampicin CAS 13292-46-1.

DsRed, ein rotes fluoreszierendes Protein, das in der Korallenart Discosoma sp. gefunden wird, hat aufgrund seiner ausgeprägten roten Fluoreszenz, die im Kontrast zum grünen GFP steht, umfangreiche Anwendung in der Molekularbiologie gefunden. Im Laufe der Zeit wurden durch Mutagenese Varianten von DsRed wie mCherry, mStrawberry und mRaspberry entwickelt, die jeweils einzigartige Eigenschaften bieten, die auf spezifische Forschungsbedürfnisse zugeschnitten sind. Zentral für die Fluoreszenz von DsRed ist sein Chromophor, eine Struktur, die posttranslational innerhalb der Proteinmatrix gebildet wird. Dieses Chromophor absorbiert Licht bei einer Wellenlänge und emittiert es bei einer anderen, was zur beobachteten roten Fluoreszenz führt. Die Reifung dieses Chromophors, die eine Reihe chemischer Reaktionen umfasst, kann durch Faktoren wie pH-Wert und Sauerstoffgehalt beeinflusst werden.

Hinsichtlich der Hemmung der Funktion von DsRed können mehrere Strategien in Betracht gezogen werden. Transkriptionelle und translationale Inhibitoren können die Produktion von DsRed unterdrücken, wobei Techniken wie RNA-Interferenz (RNAi) oder Antisense-Oligonukleotide auf seine mRNA abzielen. Eine Störung der Chromophor-Reifung oder die Einführung von Fluoreszenz-Quenchern kann die Fluoreszenz von DsRed reduzieren. Zusätzlich kann der proteolytische Abbau DsRed zum Abbau bringen, während Umweltfaktoren wie pH-Modulation oder hypoxische Bedingungen seine Fluoreszenz beeinflussen können. Obwohl DsRed kein konventionelles Ziel für eine Hemmung ist, bietet das Verständnis seiner Modulationsmechanismen wichtige Einblicke für Forscher, die dieses Werkzeug in ihrer Arbeit verwenden.