RBMという接頭辞は、一般的にRNA結合モチーフタンパク質のファミリーとの関連の可能性を示し、それらはRNAプロセシングと制御の様々な側面で役割を果たすことが知られている。もしRBM32Bがこのファミリーの一員であれば、活性化因子とは、そのRNA結合活性を増強したり、他のタンパク質パートナーとの相互作用に影響を与えたり、細胞内での安定性や発現を増加させたりする化合物であろう。活性化の正確なメカニズムは、RNAスプライシング、輸送、安定性、または翻訳における役割を含む可能性のあるRBM32Bの特定の機能に依存するであろう。このような活性化因子を同定するには、タンパク質の構造とRNAや他の高分子との相互作用を理解する必要がある。
RBM32Bアクチベーターを探索し、開発するためには、包括的な生化学的・生物物理学的アプローチが不可欠である。まず、RBM32Bの活性をモニターするアッセイ系を確立する必要がある。もしこのタンパク質がRNA結合に関与しているのであれば、EMSA(Electromobility Shift Assay)を用いて、活性化因子の存在下でのRNA-タンパク質複合体形成の変化を観察できるかもしれない。あるいは、RBM32Bが酵素活性を持つのであれば、反応速度の変化を測定する酵素速度論アッセイを開発することもできる。これらのアッセイ法を用いて、化学ライブラリーのハイスループットスクリーニングを行えば、RBM32Bの活性を調節する化合物を同定することができる。これらのスクリーニングから得られたヒット化合物は、その後、検証と最適化のプロセスを経ることになる。二次的なアッセイには、観察された活性化が非特異的な効果によるものでないことを確認するために、RNA結合阻害剤を使用することも含まれる。さらに、RBM32Bの標的活性化を確実にするために、関連するRNA結合タンパク質のパネルを用いて、これらの活性化因子の特異性を評価することもできる。
関連項目
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製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
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Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
アクチノマイシンDはDNAに結合して転写を阻害するが、これはPABPC1LのようなmRNA安定化因子をアップレギュレートする代償機構につながる可能性がある。 | ||||||
Cycloheximide | 66-81-9 | sc-3508B sc-3508 sc-3508A | 100 mg 1 g 5 g | $40.00 $82.00 $256.00 | 127 | |
真核生物のタンパク質合成を阻害し、代償反応としてmRNAの安定化の要求を高める可能性があり、PABPC1Lに影響を与える。 | ||||||
Rapamycin | 53123-88-9 | sc-3504 sc-3504A sc-3504B | 1 mg 5 mg 25 mg | $62.00 $155.00 $320.00 | 233 | |
mRNAの翻訳機構に影響を与え、PABPC1Lの発現を誘導してmRNAの安定性を調節する可能性のあるmTOR阻害剤。 | ||||||
MG-132 [Z-Leu- Leu-Leu-CHO] | 133407-82-6 | sc-201270 sc-201270A sc-201270B | 5 mg 25 mg 100 mg | $56.00 $260.00 $980.00 | 163 | |
プロテアソーム阻害剤で、細胞ストレスによりmRNAのプロセシングに関与するタンパク質の発現を増加させる可能性がある。 | ||||||
Sodium (meta)arsenite | 7784-46-5 | sc-250986 sc-250986A | 100 g 1 kg | $106.00 $765.00 | 3 | |
酸化ストレスを誘発し、PABPC1L変異体のようなmRNAを安定化させるタンパク質のアップレギュレーションを引き起こす可能性がある。 | ||||||
Mithramycin A | 18378-89-7 | sc-200909 | 1 mg | $54.00 | 6 | |
DNAに結合して転写に影響を与え、mRNA結合タンパク質の発現を変化させる可能性のある化学療法剤。 | ||||||
Chloroquine | 54-05-7 | sc-507304 | 250 mg | $68.00 | 2 | |
核酸合成に影響を与えることが知られており、ストレス下でmRNA安定性タンパク質の発現を増加させる可能性がある。 | ||||||
Gentamicin sulfate | 1405-41-0 | sc-203334 sc-203334A sc-203334F sc-203334B sc-203334C sc-203334D sc-203334E | 1 g 5 g 50 g 100 g 1 kg 2.5 kg 7.5 kg | $55.00 $175.00 $499.00 $720.00 $1800.00 $2600.00 $6125.00 | 3 | |
これらの抗生物質はmRNAの翻訳を阻害し、mRNA結合タンパク質の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Tunicamycin | 11089-65-9 | sc-3506A sc-3506 | 5 mg 10 mg | $169.00 $299.00 | 66 | |
小胞体ストレスを誘導し、mRNA プロセシングタンパク質の 発現を増加させる可能性がある、N-結合型糖鎖形成阻害剤。 | ||||||
Retinoic Acid, all trans | 302-79-4 | sc-200898 sc-200898A sc-200898B sc-200898C | 500 mg 5 g 10 g 100 g | $65.00 $319.00 $575.00 $998.00 | 28 | |
PABPC1Lのようなタンパク質を含む、遺伝子発現プロファイルに影響を与えることができる既知の分化因子。 |