Chemische Inhibitoren von DDX35 wirken über verschiedene Mechanismen, um seine Helikasefunktion zu stören, die für die RNA-Verarbeitung unerlässlich ist. Ethidiumbromid kann durch Interkalation in die RNA die RNA-Sekundärstrukturen stabilisieren, wodurch es für DDX35 schwieriger wird, die Nukleinsäurestränge zu binden und zu entwirren. Diese Stabilisierung der RNA-Strukturen durch Ethidiumbromid kann zu einer funktionellen Hemmung von DDX35 führen. Obwohl Novobiocin in erster Linie auf die DNA-Gyrase abzielt, kann es auch die Supercoiling der DNA beeinflussen. Diese veränderte Topologie kann wiederum die Verfügbarkeit oder Struktur von DNA-RNA-Hybriden beeinflussen, die potenzielle Substrate für DDX35 sind, was zu einer indirekten Hemmung seiner Aktivität führt.
Darüber hinaus zielen chemische Inhibitoren wie Aurintricarbonsäure und Distamycin A auf Nukleinsäure-Interaktionen ab, wobei erstere an Nukleinsäuren binden und möglicherweise den Zugang von DDX35 zu RNA-Substraten behindern, während letztere an die Nebenrille der DNA binden und möglicherweise die Bildung von Strukturen wie R-Schleifen, die Substrate für DDX35 sind, verändern. 5,6-Dichlor-1-β-D-ribofuranosylbenzimidazol (DRB) hemmt zelluläre Kinasen und kann somit die Phosphorylierung stören, die für die optimale Aktivität von DDX35 entscheidend ist. Bisphenol A kann durch die Bindung von Nukleinsäuren die Bindungsstellen besetzen oder die Konformation von Substraten verändern und dadurch die Helikaseaktivität von DDX35 hemmen. Ruthenium Red, ein polykationischer Farbstoff, der an Nukleinsäuren bindet, kann die Interaktion von DDX35 mit seinen Substraten behindern, während Plumbagin durch DNA-Interkalation die Verfügbarkeit von RNA-DNA-Hybriden für DDX35 beeinträchtigen kann. Camptothecin stabilisiert den DNA-Topoisomerase I-Komplex und beeinflusst die DNA-Topologie, was wiederum die Substrate für DDX35 beeinflussen kann. Schließlich kann Suramin, ein polysulfonierter Naphthylharnstoff, durch Bindung an Nukleinsäuren und Proteine verhindern, dass DDX35 Zugang zu seinen benötigten Substraten erhält, und damit seine Helikaseaktivität hemmen.
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| Produkt | CAS # | Katalog # | Menge | Preis | Referenzen | Bewertung |
|---|---|---|---|---|---|---|
Aurintricarboxylic Acid | 4431-00-9 | sc-3525 sc-3525A sc-3525B sc-3525C | 100 mg 1 g 5 g 10 g | $20.00 $31.00 $47.00 $92.00 | 13 | |
Aurintricarbonsäure hemmt Nukleinsäureenzyme, die mit Nukleinsäuren interagieren. Durch die Bindung an Nukleinsäuren kann sie den Zugang von DDX35 zu seinen RNA-Substraten blockieren und so seine Helikaseaktivität funktionell hemmen. | ||||||
Ethidium bromide | 1239-45-8 | sc-203735 sc-203735A sc-203735B sc-203735C | 1 g 5 g 25 g 100 g | $47.00 $147.00 $576.00 $2045.00 | 12 | |
Ethidiumbromid interkaliert in Nukleinsäuren, was DDX35 hemmen kann, indem es die RNA-Sekundärstrukturen stabilisiert und es der Helikase erschwert, RNA zu binden und abzuwickeln. | ||||||
Novobiocin | 303-81-1 | sc-362034 sc-362034A | 5 mg 25 mg | $96.00 $355.00 | ||
Novobiocin ist dafür bekannt, dass es auf die DNA-Gyrase abzielt, kann aber auch die DNA-Topologie beeinflussen. Durch die Veränderung der Supercoiling-Eigenschaft der DNA kann es indirekt die Substratverfügbarkeit für DDX35 beeinflussen, das im Rahmen seiner Helikasefunktion mit DNA-RNA-Hybriden oder R-Schleifen interagieren kann. | ||||||
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
Actinomycin D bindet an die DNA und kann dadurch die Transkription und auch die Bildung von DNA-RNA-Hybriden oder R-Schleifen hemmen, die DDX35 möglicherweise als Substrate für seine Helikaseaktivität benötigt. | ||||||
DRB | 53-85-0 | sc-200581 sc-200581A sc-200581B sc-200581C | 10 mg 50 mg 100 mg 250 mg | $42.00 $185.00 $310.00 $650.00 | 6 | |
DRB ist ein Kinase-Inhibitor, der zelluläre Kinasen hemmen kann. DDX35 benötigt möglicherweise eine Phosphorylierung für die volle Aktivität oder Interaktion mit phosphorylierten Proteinen; daher könnte DRB die phosphorilierungsabhängige Regulation von DDX35 reduzieren, was zu einer funktionellen Hemmung führt. | ||||||
Bisphenol A | 80-05-7 | sc-391751 sc-391751A | 100 mg 10 g | $300.00 $490.00 | 5 | |
Es wurde nachgewiesen, dass Bisphenol A an Nukleinsäuren bindet und durch diese Interaktion DDX35 hemmen kann, indem es die Struktur seiner RNA-Substrate verändert oder mit DDX35 um die Bindung an Nukleinsäuren konkurriert und so die Helikase daran hindert, ihre Funktion zu erfüllen. | ||||||
Ruthenium red | 11103-72-3 | sc-202328 sc-202328A | 500 mg 1 g | $184.00 $245.00 | 13 | |
Rutheniumrot ist ein polykationischer Farbstoff, der an Nukleinsäuren binden und DDX35 hemmen kann, indem er den Zugang zu RNA-Substraten blockiert oder deren Struktur verändert, was für die Aktivität der Helikase notwendig ist. | ||||||
Plumbagin | 481-42-5 | sc-253283 sc-253283A | 100 mg 250 mg | $51.00 $61.00 | 6 | |
Plumbagin soll sich in die DNA einfügen. Durch diese Interaktion kann es die Bildung von Substraten wie R-Schleifen oder RNA-DNA-Hybriden beeinflussen, die DDX35 für seine Helikasefunktion benötigt, was zu einer funktionellen Hemmung von DDX35 führt. | ||||||
Camptothecin | 7689-03-4 | sc-200871 sc-200871A sc-200871B | 50 mg 250 mg 100 mg | $57.00 $182.00 $92.00 | 21 | |
Camptothecin stabilisiert den DNA-Topoisomerase-I-Komplex, was zu einer Veränderung der DNA-Topologie führen kann. Solche Veränderungen können DDX35 indirekt hemmen, indem sie die Struktur und Verfügbarkeit von DNA-RNA-Hybriden oder R-Schleifen beeinflussen, auf die DDX35 im Rahmen seiner Helikasefunktion einwirken kann. | ||||||
Suramin sodium | 129-46-4 | sc-507209 sc-507209F sc-507209A sc-507209B sc-507209C sc-507209D sc-507209E | 50 mg 100 mg 250 mg 1 g 10 g 25 g 50 g | $149.00 $210.00 $714.00 $2550.00 $10750.00 $21410.00 $40290.00 | 5 | |
Suramin ist ein polysulfonierter Naphthylharnstoff, der verschiedene Enzyme hemmt. Er kann an Nukleinsäuren und Proteine binden und DDX35 hemmen, indem er verhindert, dass das Protein mit seinen RNA- oder DNA-Substraten interagiert, wodurch die Aktivität der Helikase gehemmt wird. | ||||||