Das nicht-kodierende RNA-Gen 0610008F07Rik, auch bekannt als Hnf4aos, wurde als wichtiger Akteur in den komplexen regulatorischen Netzwerken identifiziert, die die Genexpression in Mus musculus, der Hausmaus, steuern. Dieses Gen ist maßgeblich an der Regulierung des hepatischen Nuklearfaktors 4 alpha (HNF4α) beteiligt, einem nuklearen Rezeptorprotein, das für die Leberentwicklung und die allgemeine Leberfunktion entscheidend ist. Die Expression von 0610008F07Rik ist in Organen wie der Leber und der Niere deutlich höher, was auf eine besondere Rolle bei den physiologischen Prozessen in diesen Geweben hindeutet. Das Gen selbst kodiert kein Protein, sondern produziert eine nicht-kodierende RNA, die bei der Regulierung anderer Gene verschiedene Aufgaben übernehmen kann, darunter die Funktion einer molekularen Senke für regulatorische Proteine, die Modifizierung der Chromatinstruktur und die Veränderung der Stabilität und Übersetzung von Boten-RNAs.
Auf der Suche nach einem Verständnis dafür, wie die Expression von Genen wie 0610008F07Rik gesteuert werden kann, wurden verschiedene Chemikalien identifiziert, die möglicherweise als Hemmstoffe dienen könnten, wenn auch indirekt. Verbindungen wie 5-Azacytidin und Trichostatin A zielen auf breite Aspekte der epigenetischen Maschinerie ab, indem sie die DNA demethylieren bzw. die Histonacetylierung verändern, was zu einer Herunterregulierung bestimmter Gene führen kann. Andere Chemikalien wie Actinomycin D hemmen direkt die Transkriptionsmaschinerie und bieten damit ein Mittel zur Reduzierung der RNA-Synthese im gesamten Genom. Speziell für die Kategorie der nichtcodierenden RNA kann die starke Hemmung der RNA-Polymerase II durch α-Amanitin zu einer Verringerung der Menge an ncRNA-Transkripten führen. In ähnlicher Weise zeigen niedermolekulare Inhibitoren, die auf Signaltransduktionswege abzielen, wie Sirolimus, LY294002, PD98059 und SP600125, ihre Fähigkeit, die Genexpression zu beeinflussen, indem sie wichtige Kinasen hemmen, die an Zellwachstum und -differenzierung beteiligt sind. Diese Inhibitoren wirken zwar auf eine Vielzahl von zellulären Zielstrukturen, bieten aber auch die Möglichkeit, die Expression von 0610008F07Rik durch die Unterbrechung von Signalwegen und Transkriptionskontrollmechanismen, die die ncRNA-Spiegel bestimmen, selektiv herunterzuregulieren. Durch ein differenziertes Verständnis dieser chemisch-genen Interaktionen können Forscher die Rolle von 0610008F07Rik in der Zellfunktion weiter entschlüsseln.
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Produkt | CAS # | Katalog # | Menge | Preis | Referenzen | Bewertung |
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5-Azacytidine | 320-67-2 | sc-221003 | 500 mg | $280.00 | 4 | |
5-Azacytidin kann die Expression von 0610008F07Rik durch Einbau in die DNA während der Replikation und durch Demethylierung der genregulatorischen Regionen herunterregulieren, was möglicherweise zu einer Transkriptionsabschaltung führt. | ||||||
Trichostatin A | 58880-19-6 | sc-3511 sc-3511A sc-3511B sc-3511C sc-3511D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 50 mg | $149.00 $470.00 $620.00 $1199.00 $2090.00 | 33 | |
Trichostatin A könnte die Transkription von 0610008F07Rik durch Hemmung der Histon-Deacetylase-Aktivität reduzieren, was zu einem offenen Chromatin-Zustand und einer Transkriptionshemmung aufgrund des Versagens der Aufrechterhaltung der Chromatinstruktur führt. | ||||||
RG 108 | 48208-26-0 | sc-204235 sc-204235A | 10 mg 50 mg | $128.00 $505.00 | 2 | |
RG108 könnte die Expression von 0610008F07Rik durch Blockierung von DNA-Methyltransferasen verringern, was zu einer verminderten Methylierung in der Promotorregion des Gens führt, einem Marker, der oft mit Gen-Silencing in Verbindung gebracht wird. | ||||||
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
Actinomycin D kann die Transkription von 0610008F07Rik hemmen, indem es sich in die DNA einlagert und dadurch den Vorschub der RNA-Polymerase entlang der DNA-Vorlage behindert. | ||||||
α-Amanitin | 23109-05-9 | sc-202440 sc-202440A | 1 mg 5 mg | $260.00 $1029.00 | 26 | |
α-Amanitin könnte zu einem Rückgang der 0610008F07Rik-Spiegel führen, indem es spezifisch die RNA-Polymerase II hemmt, das Enzym, das für die Transkription von mRNA, snRNA und einigen miRNAs verantwortlich ist. | ||||||
Rapamycin | 53123-88-9 | sc-3504 sc-3504A sc-3504B | 1 mg 5 mg 25 mg | $62.00 $155.00 $320.00 | 233 | |
Rapamycin (Sirolimus) könnte die Expression von 0610008F07Rik herunterregulieren, indem es den mTOR-Signalweg hemmt, der für die Synthese verschiedener zellulärer Proteine und ncRNAs entscheidend ist. | ||||||
Retinoic Acid, all trans | 302-79-4 | sc-200898 sc-200898A sc-200898B sc-200898C | 500 mg 5 g 10 g 100 g | $65.00 $319.00 $575.00 $998.00 | 28 | |
Retinsäure könnte die Transkription von 0610008F07Rik durch ihre Rolle als aktiver Metabolit von Vitamin A verringern, das an Retinsäure-Rezeptoren bindet und die Transkription von Zielgenen verändert. | ||||||
Chloroquine | 54-05-7 | sc-507304 | 250 mg | $68.00 | 2 | |
Chloroquin hat das Potenzial, die Expression von 0610008F07Rik durch Störung der endosomalen Ansäuerung und autophagischer Prozesse zu verringern, was zu einer veränderten zellulären Homöostase und veränderten Genexpressionsprofilen führt. | ||||||
(±)-JQ1 | 1268524-69-1 | sc-472932 sc-472932A | 5 mg 25 mg | $226.00 $846.00 | 1 | |
JQ1 könnte zur Herunterregulierung von 0610008F07Rik führen, indem es kompetitiv an Bromodomänen von BET-Proteinen bindet, wodurch diese vom Chromatin verdrängt werden und die Expression von Genen unter ihrer Kontrolle unterdrückt wird. | ||||||
LY 294002 | 154447-36-6 | sc-201426 sc-201426A | 5 mg 25 mg | $121.00 $392.00 | 148 | |
LY 294002 hat das Potenzial, die Expression von 0610008F07Rik durch die gezielte Beeinflussung von PI3K, einer Schlüsselkinase in zellulären Signalwegen, zu hemmen, was zu einer Verringerung der nachgeschalteten Transkriptionsaktivitäten führt. |