RBM4Bアクチベーターは、スプライシング、輸送、安定化といったRNA代謝の複雑なプロセスに関与していると考えられるタンパク質であるRNA結合モチーフタンパク質4B(RBM4B)の機能的活性を増強するユニークな能力によって特徴づけられる。このような活性化因子を開発するには、タンパク質の構造とRNAとの相互作用を深く理解する必要がある。潜在的なRBM4B活性化因子のスクリーニングには、おそらく蛍光標識RNAプローブを用いて、RBM4BのRNA結合活性を定量的に測定できるアッセイが必要であろう。化学ライブラリーのハイスループットスクリーニングは、RBM4BとそのRNA基質との相互作用の強化を示す、この蛍光シグナルを増加させる化合物を同定することを目的とする。この最初のスクリーニングで得られたヒット化合物は、その後、二次的なアッセイを用いた厳密な検証プロセスを経ることになる。
これらの二次アッセイには、等温滴定カロリメトリー(ITC)や表面プラズモン共鳴(SPR)のような生物物理学的手法が含まれる可能性があり、RBM4Bと活性化因子候補との相互作用の結合速度論や熱力学の解明に役立つ。このような詳細な研究は、標的に対する活性化因子の特異性を確認し、活性化因子がRBM4Bの活性を増強するメカニズムを理解する上で重要である。検証段階に続いて、成功した分子は、X線結晶構造解析やNMR分光法を含む構造研究の対象となり、正確な結合部位をマッピングし、活性化因子の結合に伴うタンパク質のコンフォメーション変化を特定する。これらの洞察は、これらの分子の改良に道を開き、高い特異性と効力をもってRBM4Bの活性を調節できる新しいクラスの化合物の創製につながる可能性がある。
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| 製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
|---|---|---|---|---|---|---|
Pladienolide B | 445493-23-2 | sc-391691 sc-391691B sc-391691A sc-391691C sc-391691D sc-391691E | 0.5 mg 10 mg 20 mg 50 mg 100 mg 5 mg | $290.00 $5572.00 $10815.00 $25000.00 $65000.00 $2781.00 | 63 | |
これらは正常なスプライシングを阻害し、RBM4Bのようなスプライシング因子の代償的なアップレギュレーションを引き起こす可能性がある。 | ||||||
Suberoylanilide Hydroxamic Acid | 149647-78-9 | sc-220139 sc-220139A | 100 mg 500 mg | $130.00 $270.00 | 37 | |
これらはクロマチン構造と遺伝子発現を変化させ、その中にはスプライシング因子をコードする遺伝子も含まれる。 | ||||||
5-Azacytidine | 320-67-2 | sc-221003 | 500 mg | $280.00 | 4 | |
DNAのメチル化状態を変化させることにより、これらの化合物はRBM4Bを含む幅広い遺伝子の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Torin 1 | 1222998-36-8 | sc-396760 | 10 mg | $240.00 | 7 | |
mRNAの翻訳過程に変化をもたらし、RNA結合やスプライシングに関与するタンパク質の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Bortezomib | 179324-69-7 | sc-217785 sc-217785A | 2.5 mg 25 mg | $132.00 $1064.00 | 115 | |
プロテアソーム阻害によって誘導される細胞ストレスは、RBM4Bを含む様々なストレス応答タンパク質のアップレギュレーションをもたらすかもしれない。 | ||||||
Camptothecin | 7689-03-4 | sc-200871 sc-200871A sc-200871B | 50 mg 250 mg 100 mg | $57.00 $182.00 $92.00 | 21 | |
DNAの複製と修復を阻害することにより、これらの化合物は遺伝子発現に広範な変化を引き起こす可能性がある。 | ||||||
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
グローバルな転写阻害は、遺伝子発現に複雑な代償作用をもたらし、RBM4Bに影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Olaparib | 763113-22-0 | sc-302017 sc-302017A sc-302017B | 250 mg 500 mg 1 g | $206.00 $299.00 $485.00 | 10 | |
これらはDNA修復機構に影響を及ぼし、潜在的にRBM4Bを含む様々な遺伝子の転写に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Hydrogen Peroxide | 7722-84-1 | sc-203336 sc-203336A sc-203336B | 100 ml 500 ml 3.8 L | $30.00 $60.00 $93.00 | 27 | |
酸化ストレスはストレス応答遺伝子の一般的な制御因子であり、その中にはRNA結合タンパク質も含まれる。 | ||||||
17-AAG | 75747-14-7 | sc-200641 sc-200641A | 1 mg 5 mg | $66.00 $153.00 | 16 | |
分子シャペロンを標的とすることで、これらの阻害剤はストレス応答を誘導し、RNA結合タンパク質をアップレギュレートする可能性がある。 | ||||||