SMYD1阻害剤

一般的なSMYD1阻害剤には、5′-デオキシ-5′-メチルチオアデノシン CAS 2457-80-9、Chaetocin CAS 28097-03-2、 5-Aza-2′-Deoxycytidine CAS 2353-33-5、Quercetin CAS 117-39-5、MS-275 CAS 209783-80-2などがある。

SMYD1阻害剤には、クロマチンリモデリングと遺伝子発現に重要な役割を果たすリジン・メチル化酵素であるSMYD1タンパク質の活性を調節できる様々な化合物が含まれる。SMYD1を直接阻害する方法はまだ見つかっていないが、細胞経路やエピジェネティック・ランドスケープを阻害することによって、SMYD1の機能に間接的に影響を与えることができる化学物質がいくつか同定されている。これらの化合物は、SMYD1を特異的に標的とするわけではないが、SMYD1とクロマチンとの相互作用に変化をもたらし、それによってSMYD1の酵素活性とそれに続く下流の生物学的効果を調節する。SMYD1の間接的阻害剤として作用しうる化学物質の中には、5'-デオキシ-5'-メチルチオアデノシンやメチルチオアデノシンのような低分子があり、これらはメチルトランスフェラーゼ反応における一般的なメチル供与体であるS-アデノシルメチオニンの構造を模倣している。

S-アデノシルメチオニンと競合することにより、これらのアナログはSMYD1のメチル基転移酵素活性に必要なメチル基の利用可能性を減少させることができる。さらに、BIX-01294やChaetocinのような他のメチル基転移酵素の阻害剤は、ヒストンのメチル化構造を変化させ、特定のクロマチン領域におけるSMYD1の動員や活性に影響を与える可能性がある。ヒストンメチル化マークの変化はカスケード効果をもたらし、クロマチン状態を破壊し、SMYD1の基質へのアクセスや基質への作用能力に影響を与える可能性がある。さらに、DecitabineやRG108のようなDNAのメチル化に影響を与える化合物は、クロマチン上でのSMYD1の結合や作用が起こりにくい環境を作り出し、間接的な阻害剤の役割を果たす。ケルセチンやパルテノライドのような他の分子は、キナーゼ阻害からシグナル伝達経路の調節まで、多様なメカニズムで作用し、SMYD1の活性に影響を与える細胞状態の変化をもたらす。