Chemische Inhibitoren von YTHDF1 beeinträchtigen seine Fähigkeit, an m6A-modifizierte RNA zu binden, ein entscheidender Aspekt seiner Funktion im RNA-Stoffwechsel. Rhodamin 6G, Methylenblau, Chloroquin, Daunorubicin, Doxorubicin und Ellipticin wirken über einen Mechanismus, bei dem sie sich in die RNA einlagern. Diese Einlagerung blockiert wahrscheinlich die Bindungsstellen auf der RNA und hindert YTHDF1 daran, seine Ziele zu erreichen. Propidiumiodid hat eine ähnliche Wirkungsweise, indem es sich in die RNA-Struktur einfügt und möglicherweise mit YTHDF1 um die Interaktion mit m6A-Stellen konkurriert. Eriochrom Black T hingegen verfolgt einen anderen Ansatz, indem es Metallionen chelatiert, die für die strukturelle Integrität und Funktion von YTHDF1 von entscheidender Bedeutung sind, und so seine RNA-Bindungsfähigkeit behindert.
Aurintricarbonsäure blockiert die Wechselwirkung zwischen Nukleinsäuren und Proteinen und hemmt so die Bindung von YTHDF1 an m6A-Stellen auf der RNA. Emetin verfolgt eine andere Hemmungsstrategie, indem es an ribosomale RNA bindet, was zu einer sterischen Behinderung führen oder Konformationsänderungen in der ribosomalen RNA hervorrufen kann, was zu einer verringerten Interaktion zwischen YTHDF1 und seinen m6A-modifizierten RNA-Zielen führt. Mitoxantron hat einen ähnlichen Mechanismus wie die Interkalationsmittel, unterscheidet sich jedoch in seiner chemischen Struktur. Actinomycin D beeinträchtigt zwar nicht direkt die Funktion von YTHDF1, bindet aber an die DNA und behindert die RNA-Transkription, was wiederum die Gesamtverfügbarkeit von RNA für die YTHDF1-Bindung verringern könnte. Jede dieser Chemikalien stört durch ihre jeweilige Wirkungsweise die normale Funktion von YTHDF1 bei der Verarbeitung von m6A-modifizierten RNA-Molekülen.
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| Produkt | CAS # | Katalog # | Menge | Preis | Referenzen | Bewertung |
|---|---|---|---|---|---|---|
Aurintricarboxylic Acid | 4431-00-9 | sc-3525 sc-3525A sc-3525B sc-3525C | 100 mg 1 g 5 g 10 g | $20.00 $32.00 $48.00 $94.00 | 13 | |
Aurintricarbonsäure ist dafür bekannt, dass sie Nukleinsäure-Protein-Wechselwirkungen hemmt. Sie kann YTHDF1 hemmen, indem sie dessen Bindung an m6A-Stellen auf RNA verhindert, was für die Funktion von YTHDF1 im RNA-Stoffwechsel unerlässlich ist. | ||||||
Methylene blue | 61-73-4 | sc-215381B sc-215381 sc-215381A | 25 g 100 g 500 g | $43.00 $104.00 $328.00 | 3 | |
Methylenblau kann YTHDF1 hemmen, indem es sich in die RNA einlagert, was die Bindung von YTHDF1 an die m6A-modifizierte RNA hemmen kann, eine kritische Interaktion für seine Funktion. | ||||||
Chloroquine | 54-05-7 | sc-507304 | 250 mg | $69.00 | 2 | |
Es ist bekannt, dass Chloroquin in DNA und RNA interkaliert, was YTHDF1 hemmen kann, indem es seine Interaktion mit m6A-modifizierter RNA blockiert und damit seine Fähigkeit, den RNA-Stoffwechsel zu regulieren, beeinträchtigt. | ||||||
Emetine | 483-18-1 | sc-470668 sc-470668A sc-470668B sc-470668C | 1 mg 10 mg 50 mg 100 mg | $440.00 $900.00 $1400.00 $2502.00 | ||
Emetin kann YTHDF1 durch Bindung an ribosomale RNA hemmen und so möglicherweise verhindern, dass YTHDF1 aufgrund sterischer Hinderung oder Konformationsänderungen in der ribosomalen RNA mit seinen Ziel-m6A-modifizierten RNAs interagiert. | ||||||
Daunorubicin hydrochloride | 23541-50-6 | sc-200921 sc-200921A sc-200921B sc-200921C | 10 mg 50 mg 250 mg 1 g | $105.00 $438.00 $837.00 $1569.00 | 4 | |
Daunorubicin lagert sich in DNA und RNA ein und kann YTHDF1 hemmen, indem es die Bindungsstellen für YTHDF1 auf m6A-modifizierten RNAs blockiert und so dessen Funktion beeinträchtigt. | ||||||
Mitoxantrone | 65271-80-9 | sc-207888 | 100 mg | $285.00 | 8 | |
Mitoxantron lagert sich in DNA und RNA ein und kann die Interaktion von YTHDF1 mit m6A-modifizierter RNA hemmen, indem es den Zugang dieser RNAs zu YTHDF1 blockiert. | ||||||
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $74.00 $243.00 $731.00 $2572.00 $21848.00 | 53 | |
Actinomycin D bindet an DNA und kann YTHDF1 hemmen, indem es die Transkription von RNA verhindert und so indirekt die Menge an RNA reduziert, an die YTHDF1 binden kann. Dies ist eine nicht bevorzugte Hemmungsmethode, die nicht direkt auf die Funktion des Proteins abzielt. | ||||||
Doxorubicin | 23214-92-8 | sc-280681 sc-280681A | 1 mg 5 mg | $176.00 $426.00 | 43 | |
Doxorubicin kann durch Interkalation in die RNA YTHDF1 hemmen, indem es dessen Bindung an m6A-modifizierte RNA verhindert, die für die Rolle des Proteins im RNA-Stoffwechsel entscheidend ist. | ||||||
Ellipticine | 519-23-3 | sc-200878 sc-200878A | 10 mg 50 mg | $145.00 $569.00 | 4 | |
Ellipticin wirkt durch Interkalation in DNA und RNA und kann YTHDF1 hemmen, indem es seine Interaktion mit m6A-modifizierter RNA blockiert und so seine Funktion hemmt. | ||||||
Propidium Iodide | 25535-16-4 | sc-3541 sc-3541A | 50 mg 250 mg | $101.00 $296.00 | 168 | |
Propidiumjodid ist ein Nukleinsäure-Interkalator und kann YTHDF1 hemmen, indem es sich in die RNA einlagert und dadurch möglicherweise mit YTHDF1 um die Bindung an m6A-modifizierte RNA konkurriert. | ||||||