DDX19B Inhibitoren

Gängige DDX19B Inhibitors sind unter underem Novobiocin CAS 303-81-1, Aurintricarboxylic Acid CAS 4431-00-9, Ethidium bromide CAS 1239-45-8, Berberine CAS 2086-83-1 und Amsacrine hydrochloride CAS 54301-15-4.

Chemische Inhibitoren von DDX19B zielen auf die wesentlichen Funktionen des Proteins ab, wie die ATP-Hydrolyse und die RNA-Bindung, die für seine Helikase-Aktivität beim nukleozytoplasmatischen Transport von RNA entscheidend sind. Novobiocin erfüllt eine ähnliche Funktion, indem es an die ATPase-Domäne von DDX19B bindet und dadurch die für die RNA-Helikasefunktion erforderlichen Konformationsänderungen verhindert. Aurintricarboxylsäure hemmt DDX19B, indem sie die Interaktion zwischen dem Protein und der RNA behindert, da sie an die Nukleinsäure-Bindungsstellen von DDX19B bindet, was das Protein daran hindert, seine RNA-Abwicklungsfunktion zu erfüllen. Eine weitere Strategie, die von Inhibitoren wie Ethidiumbromid und Berberin angewandt wird, ist die Störung der Nukleinsäurestrukturen. Diese Verbindungen interkalieren mit Nukleinsäuren, verändern deren Struktur und hemmen so die Fähigkeit von DDX19B, sein Substrat zu binden oder abzuwickeln.

Weitere Chemikalien wie Amsacrin und Mitoxantron stören die Funktion von DDX19B auf ähnliche Weise. Indem sie sich in die DNA einfügen, schaffen sie eine verzerrte Nukleinsäurestruktur, mit der DDX19B nicht wirksam in Kontakt treten kann, wodurch seine Helikase-Aktivität behindert wird. Actinomycin D bindet an die DNA und behindert die DNA-abhängige RNA-Synthese, was zu einer Hemmung von DDX19B durch sterische Hinderung führt und das Protein an der Wechselwirkung mit seinem RNA-Substrat hindert. Suramin und Heparin hemmen DDX19B über einen anderen Mechanismus; sie binden an das Protein und behindern seine Interaktion mit RNA-Substraten, die für seine Helikase-Aktivität wesentlich ist. Oxaliplatin bildet DNA-Addukte und Vernetzungen, die von DDX19B nicht leicht aufgespalten werden können, was zur Hemmung der Helikaseaktivität des Proteins führt. Daunorubicin schließlich verhindert durch seine Interkalation in die DNA die Entfaltung von DDX19B und hemmt damit die Rolle des Proteins beim nukleozytoplasmatischen Transport von RNA.