BAF57 Inhibitoren

Gängige BAF57 Inhibitors sind unter underem (+/-)-JQ1, I-BET 151 Hydrochloride CAS 1300031-49-5 (non HCl Salt), EPZ6438 CAS 1403254-99-8, UNC1999 CAS 1431612-23-5 und GSK126.

Die Wirkung von BAF57-Inhibitoren würde sich auf die Störung der normalen Funktion des SWI/SNF-Komplexes konzentrieren. Dies könnte durch Veränderung der Konformation von BAF57, durch Verhinderung seines Einbaus in den Komplex oder durch Blockierung seiner Interaktionsstellen erreicht werden. So könnte beispielsweise ein Molekül, das die DNA- oder Histonstruktur nachahmt, an BAF57 binden und dadurch seine normale Funktion im Chromatinumbauprozess konkurrierend hemmen. Alternativ könnte eine Verbindung an die ATPase-Domäne der assoziierten BRG1- oder hBRM-Proteine binden, die für den energieabhängigen Umbau des Chromatins unerlässlich sind, und so BAF57 indirekt daran hindern, seine Rolle in diesem Prozess auszuüben.

Diese Inhibitoren würden im Wesentlichen die Rekrutierung des SWI/SNF-Komplexes zu den Zielgenen behindern oder die Umbauaktivität des Komplexes abwürgen, was zu Veränderungen der Genexpressionsmuster führt. Die fein abgestimmte Spezifität, die erforderlich ist, um BAF57 innerhalb des SWI/SNF-Komplexes selektiv zu hemmen, stellt eine große Herausforderung dar, da der Komplex für seine dynamische Zusammensetzung und eine Vielzahl von Interaktionen mit verschiedenen Proteinen und DNA-Regionen bekannt ist. Die Entwicklung solcher Inhibitoren würde daher ein tiefes Verständnis der Strukturbiologie von BAF57 und der komplizierten Funktionsweise des Chromatinumbauprozesses erfordern. Insgesamt würden BAF57-Inhibitoren eine Klasse von Wirkstoffen darstellen, die in der Lage sind, die Genexpression zu modulieren, indem sie direkt in die Maschinerie des Chromatinumbaus auf der Ebene der Aktivität und der Interaktionen von BAF57 innerhalb des Zellkerns eingreifen.