Os activadores químicos do OAT6 incluem uma variedade de compostos que interagem com a via do recetor de estrogénio para modular a atividade da proteína. A estrona, um estrogénio natural, pode ativar o OAT6 ligando-se aos receptores de estrogénio, que, por sua vez, interagem com as regiões promotoras dos genes que codificam este transportador, levando a um aumento da atividade. Do mesmo modo, o estrogénio sintético dietilestilbestrol ativa o OAT6 através de um mecanismo comparável, ligando-se aos receptores de estrogénio e alterando potencialmente a regulação da transcrição dos genes relacionados com o transporte de aniões orgânicos. Os fitoestrogénios, como a genisteína e o kaempferol, também activam a OAT6 agonizando os receptores de estrogénios, o que resulta no aumento da atividade de transporte da proteína devido a um aumento da expressão genética. A crisina, outro agonista parcial dos receptores de estrogénio, segue uma via semelhante que conduz à ativação transcricional da OAT6.
Outros produtos químicos que activam o OAT6 fazem-no através de várias vias que também se cruzam com a sinalização dos receptores de estrogénio. O bisfenol A, por exemplo, aumenta a atividade funcional do OAT6 ao interagir com receptores nucleares, que depois se ligam aos genes que codificam este transportador. O indole-3-carbinol e a naringenina activam o OAT6 através da modulação da via do recetor de estrogénio, resultando num aumento da atividade proteica devido a uma maior expressão genética. Compostos como o resveratrol activam o OAT6 através da sua influência nas vias SIRT1 e AMPK, que são conhecidas por interagirem com a sinalização do recetor de estrogénio. A curcumina e o ácido elágico exercem os seus efeitos no OAT6 através do impacto nos receptores nucleares e nas vias de sinalização associadas que influenciam a expressão e a função dos transportadores de aniões orgânicos. Por último, o isotiocianato de benzilo pode aumentar a atividade do OAT6 influenciando as vias de desintoxicação celular, o que, por sua vez, aumenta a procura de transportadores de aniões orgânicos.
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