ヒストンクラスター2 H2AB活性化剤として知られる理論的な化学クラスは、ここではH2ABと呼ばれるヒストンH2Aタンパク質の変異体を標的とし、それと相互作用するように特異的にデザインされた化合物群を指す。ヒストンH2Aは、H2A、H2B、H3、H4の対からなるヒストン8量体にDNAが巻き付いたクロマチンの基本的な組織単位であるヌクレオソームの中心的な構成成分の一つである。特定のH2AB変異体は、おそらく他のヒストンH2Aとは異なるユニークな構造的特徴や翻訳後修飾を持ち、ヌクレオソームアセンブリ、クロマチンフォールディング、遺伝子発現制御におけるその役割に影響を及ぼす可能性がある。この変異体を標的とする活性化因子は、H2ABに結合し、DNAや他のヒストンタンパク質との相互作用を調節する分子であろう。これらの活性化因子の結合はヌクレオソームの構造と安定性に影響を与え、ひいてはクロマチンの高次構造を変化させ、クロマチン構築の正確な制御に依存するプロセスに影響を与える可能性がある。
H2AB活性化因子の同定と探索には、化学的手法と生物学的手法の両方を用いた多面的アプローチが必要であろう。最初の発見には、H2ABに選択的に結合する分子の化学ライブラリーをスクリーニングすることが必要であろう。コンビナトリアルケミストリーやハイスループットスクリーニングアッセイのような技術は、蛍光ベースの読み出しや生物発光共鳴エネルギー移動(BRET)を利用する可能性があり、目的の活性を持つ化合物を同定するのに役立つだろう。潜在的な活性化因子が発見されたら、H2AB変異体と相互作用するメカニズムを解明するためにさらなる分析が必要であろう。X線結晶構造解析やクライオ電子顕微鏡を含む構造生物学的技術は、活性化因子-H2AB複合体の詳細な観察を可能にし、相互作用の分子的基盤やヒストンの構造変化を明らかにするであろう。ヌクレオソームの再構成やクロマチンコンパクションを調べるような機能的アッセイによって、H2AB活性化因子がヌクレオソームの動態やクロマチン構造にどのような影響を与えるかについての知見が得られるであろう。さらに、ChIP-seqのようなゲノムワイドな技術を用いて、ゲノム内のH2ABの分布を調べ、活性化因子の結合がH2ABのゲノム局在や機能にどのような影響を与えるかを理解することができる。このようなレベルの研究は、クロマチンにおけるヒストン変異体特異的制御と、ゲノムDNAの複雑な組織制御に対するその意味合いについての理解を深めるだろう。
関連項目
| 製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
|---|---|---|---|---|---|---|
Suberoylanilide Hydroxamic Acid | 149647-78-9 | sc-220139 sc-220139A | 100 mg 500 mg | $133.00 $275.00 | 37 | |
HDAC阻害剤は、ヒストンのアセチル化を増加させ、ヒストン遺伝子を含む特定の遺伝子のアップレギュレーションを引き起こす可能性がある。 | ||||||
Romidepsin | 128517-07-7 | sc-364603 sc-364603A | 1 mg 5 mg | $218.00 $634.00 | 1 | |
もう一つのHDAC阻害剤は、ヒストンのアセチル化を促進し、遺伝子発現パターンに影響を与える可能性がある。 | ||||||
Disulfiram | 97-77-8 | sc-205654 sc-205654A | 50 g 100 g | $53.00 $89.00 | 7 | |
アセトアルデヒド脱水素酵素の阻害剤で、間接的にヒストンのアセチル化を調節し、遺伝子の転写に影響を与える。 | ||||||
Mocetinostat | 726169-73-9 | sc-364539 sc-364539B sc-364539A | 5 mg 10 mg 50 mg | $214.00 $247.00 $1463.00 | 2 | |
ヒストンアセチル化に影響を与え、それによってさまざまな遺伝子の発現に影響を与える可能性があるHDAC阻害剤。 | ||||||
MS-275 | 209783-80-2 | sc-279455 sc-279455A sc-279455B | 1 mg 5 mg 25 mg | $24.00 $90.00 $212.00 | 24 | |
他のHDAC阻害剤と同様に作用し、ヒストンのアセチル化を増加させ、遺伝子発現に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
RGFP966 | 1357389-11-7 | sc-507300 | 5 mg | $115.00 | ||
ヒストンのアセチル化を修飾し、遺伝子発現を制御するHDAC3特異的阻害剤。 | ||||||
(±)-JQ1 | 1268524-69-1 | sc-472932 sc-472932A | 5 mg 25 mg | $231.00 $863.00 | 1 | |
BETブロモドメイン阻害剤で、転写因子やクロマチンリモデリングに影響を与え、遺伝子発現に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
I-BET 151 Hydrochloride | 1300031-49-5 (non HCl Salt) | sc-391115 | 10 mg | $450.00 | 2 | |
もう一つのBETブロモドメイン阻害剤は、転写とクロマチン構造に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
GDC-0980 | 1032754-93-0 | sc-364499 sc-364499A | 5 mg 50 mg | $347.00 $1428.00 | ||
ヒストンの脱アセチル化に影響を与え、様々な遺伝子の転写に影響を与える可能性のあるSIRT1活性化因子。 | ||||||
5-Aza-2′-Deoxycytidine | 2353-33-5 | sc-202424 sc-202424A sc-202424B | 25 mg 100 mg 250 mg | $218.00 $322.00 $426.00 | 7 | |
DNAの脱メチル化を引き起こし、ヒストンを含む遺伝子発現に変化をもたらす可能性のあるDNAメチル化酵素阻害剤。 | ||||||