H3-K9-HMTase阻害剤

一般的なH3-K9-HMTase阻害剤には、Chaetocin CAS 28097-03-2、BIX01294塩酸塩 CAS 1392399-03-9、 UNC0638 CAS 1255580-76-7、Epz004777 CAS 1338466-77-5、キナクリン、二塩酸塩 CAS 69-05-6 などがある。

H3-K9-HMTaseの化学的阻害剤には、酵素活性を低下させるためにタンパク質と異なる方法で相互作用する様々な化合物が含まれる。Chaetocinはそのような阻害剤の一つで、H3-K9-HMTaseの活性部位に直接結合し、それによって酵素がヒストンH3リジン9残基にメチル基を転移する能力を阻害する。同様に、BIX-01294は、ペプチド基質とメチル基転移に重要な補酵素S-アデノシルメチオニン（SAM）の両方と競合し、その結果、酵素のメチル化活性が低下する。UNC0638は、SETDB1 HMTaseに対する特異性は高いが、酵素が基質と相互作用するのを阻害することにより、H3-K9-HMTaseを阻害し、ヒストンのメチル化を低下させる。

これらの直接阻害剤に加えて、他の化合物も異なるメカニズムでH3-K9-HMTase活性を阻害することができる。例えば、EPZ004777はH3-K9-HMTaseのSAM結合ポケットに結合し、補酵素がメチル化過程に参加するのを阻害することができる。IOX1は、主に2-オキソグルタル酸依存性オキシゲナーゼの阻害剤であるが、H3-K9-HMTaseが標的とするメチル化マークを増加させ、ヒストン脱メチル化の利用可能性を制限することにより、間接的にその機能的活性を低下させることができる。3-Deazaneplanocin A (DZNep)は、H3-K9-HMTaseのメチル化酵素作用に不可欠なSAMの細胞内レベルを低下させる。キナクリンはDNAのインターカレーションによってクロマチン構造を変化させ、基質であるヒストンにアクセスしにくくすることでH3-K9-HMTaseを阻害することができる。シネフンギンは、H3-K9-HMTaseを含む様々なメチル化酵素の活性部位に対してSAMと競合し、それによってメチル化プロセスを阻害する。さらに、DecitabineやRG108のようなDNAメチル化酵素阻害剤は、エピジェネティックな景観や基質の利用可能性を変化させることにより、間接的にH3-K9-HMTaseに影響を与える可能性がある。最後に、アデノシンジアルデヒドは、SAM依存性メチル基転移酵素の産物阻害剤であるS-アデノシルホモシステインのレベルを増加させ、これもH3-K9-HMTaseの機能阻害をもたらす可能性がある。これらの化学物質はそれぞれ酵素またはその関連経路と相互作用して、H3-K9-HMTaseの適切な機能を阻害し、ヒストンH3の9番目のリジン位置でのメチル化を妨げる。