Inhibiteurs GEN1

Les inhibiteurs courants de GEN1 comprennent, entre autres, la 1,10-phénanthroline CAS 66-71-7, l'EGTA CAS 67-42-5, l'acide phosphonoacétique CAS 4408-78-0, la suramine sodique CAS 129-46-4 et la berbérine CAS 2086-83-1.

Les inhibiteurs chimiques de GEN1 peuvent entraver sa fonction par différents modes d'action, principalement en affectant sa capacité à interagir avec l'ADN et les cofacteurs essentiels à son activité de nucléase. La phénanthroline et la 1,10-phénanthroline agissent comme des agents chélateurs qui séquestrent les ions métalliques, indispensables à l'activité catalytique de GEN1. En chélatant ces ions métalliques, ces produits chimiques inhibent efficacement la fonction enzymatique de GEN1. De même, l'EDTA inhibe la GEN1 en chélatant les ions magnésium, qui sont des cofacteurs contribuant à la stabilisation de la structure de l'ADN et de la configuration de l'enzyme nécessaires à l'activité de la GEN1. L'EGTA joue également un rôle, bien que de manière plus indirecte, en liant les ions calcium et en modifiant potentiellement l'environnement cellulaire local dans lequel GEN1 opère, ce qui peut avoir un effet négatif sur son activité.

En outre, des produits chimiques tels que l'acide phosphonoacétique, la berbérine, la mitoxantrone, l'ellipticine et l'amsacrine interfèrent avec l'accès de GEN1 à son substrat ADN. L'acide phosphonoacétique, bien que traditionnellement connu pour inhiber les ADN polymérases, peut réduire la disponibilité des substrats de l'ADN nécessaires à l'action de GEN1 en altérant la synthèse de l'ADN. La berbérine, la mitoxantrone, l'ellipticine et l'amsacrine sont des intercalateurs d'ADN; ils s'insèrent entre les paires de bases de l'ADN, ce qui peut entraver la capacité de GEN1 à se lier à l'ADN et à le cliver. La suramine, qui n'est pas un intercalant de l'ADN, peut se lier à diverses enzymes et bloquer de la même manière l'accès de GEN1 aux structures de l'ADN. En outre, l'iodoacétamide cible directement la protéine en alkylant les résidus cystéine, ce qui pourrait entraîner une perte de fonction de GEN1 si ces résidus sont essentiels pour son activité endonucléasique. Enfin, la β-Lapachone est incluse pour son potentiel d'inhibition des nucléases, ce qui suggère qu'elle pourrait interagir avec le domaine nucléase de GEN1 et l'inhiber, empêchant ainsi son action sur l'ADN.