EZHIP (proteína inhibidora de EZH) funciona principalmente antagonizando el complejo represor policomb 2 (PRC2), lo que afecta a la estructura de la cromatina y a la expresión génica. Ciertos inhibidores de moléculas pequeñas dirigidos contra las histonas desacetilasas (HDAC) contribuyen a que el paisaje de la cromatina sea más abierto y accesible, un estado favorable para que EZHIP se una e inhiba su principal diana, EZH2, dentro del complejo PRC2. Esta relajación de la cromatina no sólo facilita la acción inhibidora de EZHIP, sino que también puede mejorar su eficacia de unión y su estabilidad en los sitios de la cromatina, reforzando su papel en la represión génica. Además, la función de EZHIP se ve complementariamente reforzada por la acción de inhibidores específicos de las ADN metiltransferasas. Al reducir los niveles de metilación del ADN, estos inhibidores pueden conducir a la desmetilación del promotor del gen EZHIP, lo que a su vez puede resultar en un aumento de la expresión de la propia EZHIP, amplificando así su impacto regulador sobre la expresión génica a través de un mecanismo de retroalimentación.
Además de dirigirse a los modificadores epigenéticos, otros compuestos que influyen en las vías de señalización celular pueden facilitar indirectamente la actividad funcional de EZHIP. Los inhibidores de EZH2 y EZH1, que son componentes básicos del complejo PRC2, pueden actuar en sinergia con la función inhibidora natural de EZHIP, provocando una reducción más pronunciada de la metilación de histonas y la consiguiente represión génica. Esta reducción de la actividad de PRC2 puede permitir a EZHIP ejercer sus efectos de forma más robusta. Además, inhibidores específicos de vías de señalización pueden modular el entorno celular de manera que favorezca la actividad de EZHIP. Por ejemplo, la inhibición de ciertas vías da lugar a patrones de expresión génica alterados que podrían conducir a la regulación al alza de EZHIP o potenciar su función supresora al influir en el entorno transcripcional.
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