ZNF780B-Aktivatoren sind eine Klasse chemischer Verbindungen, die darauf zugeschnitten sind, die Aktivität des Zinkfingerproteins 780B (ZNF780B), das zur Familie der Zinkfingerproteine gehört, zu modulieren. Zinkfingerproteine sind eine große Familie von Proteinen, die DNA erkennen und an sie binden können und für eine Vielzahl biologischer Prozesse entscheidend sind, darunter DNA-Erkennung, RNA-Verpackung, Transkriptionsaktivierung, Regulierung der Apoptose sowie Proteinfaltung und -zusammensetzung. Die spezifischen biologischen Funktionen von ZNF780B sind noch nicht vollständig geklärt, aber es wird vermutet, dass es wie andere Zinkfingerproteine an der Transkriptionsregulation von Genen beteiligt ist. Die Aktivatoren von ZNF780B sind daher so konzipiert, dass sie an dieses Protein binden und seine Fähigkeit zur Interaktion mit seinen Zielgenen verstärken, wodurch die Expression von Genen in seinem Regulationsbereich beeinflusst werden kann. Die Entwicklung von ZNF780B-Aktivatoren erfordert ein umfassendes Verständnis der Struktur des Proteins, insbesondere der Zinkfinger-Motive, die die DNA-Bindung vermitteln.
Bei der Entdeckung und Optimierung von ZNF780B-Aktivatoren werden in der Regel Hochdurchsatz-Screening-Methoden eingesetzt, um Verbindungen zu identifizieren, die die Funktion des Proteins beeinflussen können. Diese Assays müssen sorgfältig konzipiert sein, um eine Erhöhung der ZNF780B-Aktivität nachzuweisen. Die ersten Treffer aus diesem Screening stellen Verbindungen dar, die das Potenzial haben, ZNF780B zu aktivieren, aber durch sekundäre Assays weiter validiert werden müssen, um sicherzustellen, dass ihre Auswirkungen spezifisch für ZNF780B sind und nicht andere Zinkfingerproteine oder Off-Targets innerhalb der Zelle aktivieren. Nach der Bestätigung werden diese ersten Treffer einem strengen Prozess der chemischen Optimierung unterzogen. Strukturelle Untersuchungen von ZNF780B, möglicherweise durch Röntgenkristallographie oder NMR-Spektroskopie, können detaillierte Informationen über die Wechselwirkung zwischen ZNF780B und den Aktivatoren liefern. Anhand dieser Erkenntnisse können die chemischen Strukturen verändert werden, um die Spezifität und Wirksamkeit der Wechselwirkungen zu verbessern. Computergestützte Methoden wie molekulares Docking und dynamische Simulationen könnten ebenfalls eingesetzt werden, um vorherzusagen, wie sich Änderungen der Aktivatorstruktur auf die Bindungswirksamkeit auswirken könnten. Durch einen zyklischen Prozess der Modifizierung und Prüfung sollen diese Moleküle verfeinert werden, um eine selektivere und effizientere Aktivierung von ZNF780B zu erreichen und so unser Verständnis der Rolle des Proteins bei der Genregulierung und des breiteren Kontexts seiner Aktivität in zellulären Prozessen zu verbessern.
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Produkt | CAS # | Katalog # | Menge | Preis | Referenzen | Bewertung |
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5-Azacytidine | 320-67-2 | sc-221003 | 500 mg | $280.00 | 4 | |
Dieser DNA-Methyltransferase-Inhibitor könnte zu einer Hypomethylierung von Genpromotoren führen, was die Expression von ZNF780B beeinträchtigen könnte. | ||||||
Suberoylanilide Hydroxamic Acid | 149647-78-9 | sc-220139 sc-220139A | 100 mg 500 mg | $130.00 $270.00 | 37 | |
Als Histon-Deacetylase-Inhibitor könnte Vorinostat die Chromatinstruktur entspannen und die Transkription verschiedener Gene, darunter möglicherweise auch ZNF780B, verbessern. | ||||||
RG 108 | 48208-26-0 | sc-204235 sc-204235A | 10 mg 50 mg | $128.00 $505.00 | 2 | |
Ein weiterer DNA-Methyltransferase-Inhibitor, der zu einer Demethylierung des Genpromotors führen kann, was möglicherweise die Expression von ZNF780B erhöht. | ||||||
D,L-Sulforaphane | 4478-93-7 | sc-207495A sc-207495B sc-207495C sc-207495 sc-207495E sc-207495D | 5 mg 10 mg 25 mg 1 g 10 g 250 mg | $150.00 $286.00 $479.00 $1299.00 $8299.00 $915.00 | 22 | |
Diese Verbindung kann die Expression von Entgiftungsenzymen beeinflussen und möglicherweise die Genexpression durch epigenetische Mechanismen beeinflussen. | ||||||
Retinoic Acid, all trans | 302-79-4 | sc-200898 sc-200898A sc-200898B sc-200898C | 500 mg 5 g 10 g 100 g | $65.00 $319.00 $575.00 $998.00 | 28 | |
Das Vitamin-A-Derivat kann die Genexpression über Retinsäure-Rezeptoren modulieren und möglicherweise die ZNF780B-Expression beeinflussen. | ||||||
Disulfiram | 97-77-8 | sc-205654 sc-205654A | 50 g 100 g | $52.00 $87.00 | 7 | |
Es kann das Proteasom und den NF-κB-Signalweg modulieren und so möglicherweise die Expression verschiedener Gene beeinflussen. | ||||||
Genistein | 446-72-0 | sc-3515 sc-3515A sc-3515B sc-3515C sc-3515D sc-3515E sc-3515F | 100 mg 500 mg 1 g 5 g 10 g 25 g 100 g | $26.00 $92.00 $120.00 $310.00 $500.00 $908.00 $1821.00 | 46 | |
Ein Phytoöstrogen, das als Tyrosinkinase-Inhibitor wirken und die Genexpression durch epigenetische Mechanismen beeinflussen kann. | ||||||
5-Aza-2′-Deoxycytidine | 2353-33-5 | sc-202424 sc-202424A sc-202424B | 25 mg 100 mg 250 mg | $214.00 $316.00 $418.00 | 7 | |
Ähnlich wie 5-Azacytidin wird Decitabin eingesetzt, um die Methylierung der DNA zu verringern, was sich möglicherweise auf die Expression von ZNF780B auswirkt. | ||||||
Mithramycin A | 18378-89-7 | sc-200909 | 1 mg | $54.00 | 6 | |
Es bindet an GC-reiche Sequenzen in der DNA und kann so die Transkription bestimmter Gene, einschließlich ZNF780B, beeinträchtigen. | ||||||
Polyinosinic-polycytidylic acid potassium salt | 31852-29-6 | sc-202767 | 5 mg | $194.00 | ||
Es handelt sich um ein synthetisches Analogon der doppelsträngigen RNA, das eine Immunreaktion auslösen und die Genexpressionsmuster verändern kann. |