Bei den ZIM3-Aktivatoren handelt es sich um eine Gruppe von Chemikalien, die speziell darauf ausgerichtet sind, die Aktivität des Zinkfingerproteins ZIM3, eines Mitglieds der ZIM-Proteinfamilie, zu erhöhen. Zinkfingerproteine zeichnen sich durch ihre fingerartigen Ausstülpungen aus, die an Zinkionen binden und die Fähigkeit des Proteins zur Interaktion mit DNA, RNA oder anderen Proteinen erleichtern. Es ist bekannt, dass ZIM3 solche Zinkfingermotive enthält, die es ihm ermöglichen, an spezifische genetische Elemente zu binden und eine Rolle bei der Regulierung der Genexpression zu spielen. ZIM3-Aktivatoren sind daher so konzipiert, dass sie mit diesem Protein in einer Weise interagieren, die seine native Funktion in der Zelle verstärkt. Die Entwicklung dieser Aktivatoren erfordert ein tiefes Verständnis der Struktur von ZIM3, der speziellen Zinkfingerdomänen, die für seine Aktivität verantwortlich sind, und der molekularen Mechanismen, durch die es mit Nukleinsäuren oder anderen zellulären Komponenten interagiert.
Die Identifizierung von ZIM3-Aktivatoren beginnt in der Regel mit einem umfassenden Screening chemischer Bibliotheken, gefolgt von einem sorgfältigen Auswahlverfahren, um die Verbindungen herauszufiltern, die die Aktivität von ZIM3 spezifisch erhöhen können. Diese primären Kandidaten werden dann einer Reihe von Tests unterzogen, um ihre gezielte Wirkung auf ZIM3 zu bestätigen und sicherzustellen, dass sie nicht versehentlich die Aktivität anderer Zinkfingerproteine oder nicht verwandter zellulärer Proteine beeinflussen. Sobald die Spezifität festgestellt ist, werden diese Verbindungen weiter optimiert, um ihre Wirksamkeit und Selektivität zu verbessern. Dazu können strukturelle Veränderungen gehören, die auf Erkenntnissen aus fortgeschrittenen Techniken wie der Röntgenkristallographie beruhen, die eine detaillierte dreidimensionale Struktur des ZIM3-Proteins im Komplex mit dem Aktivator liefern kann. Darüber hinaus kann die computergestützte Modellierung das rationale Design der Moleküle leiten, um ihre Bindungsaffinität und funktionelle Wirksamkeit zu verbessern. In iterativen Synthese- und Testzyklen arbeiten Chemiker und Biologen zusammen, um diese Moleküle zu potenten und selektiven ZIM3-Aktivatoren zu verfeinern. Das letztendliche Ziel dieses Optimierungsprozesses ist die Gewinnung von Verbindungen, die die Aktivität von ZIM3 zuverlässig modulieren können, was wiederum dazu beitragen kann, die Rolle des Proteins bei der zellulären Genregulierung aufzuklären und Einblicke in das komplexe Netzwerk von Protein-DNA-Interaktionen zu geben, die die Zellfunktionen steuern.
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Produkt | CAS # | Katalog # | Menge | Preis | Referenzen | Bewertung |
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5-Azacytidine | 320-67-2 | sc-221003 | 500 mg | $280.00 | 4 | |
Dieser Wirkstoff kann die DNA-Methyltransferase hemmen, was möglicherweise zu einer Hypomethylierung des ZIM3-Gens führt, was dessen Expression aktivieren kann. | ||||||
5-Aza-2′-Deoxycytidine | 2353-33-5 | sc-202424 sc-202424A sc-202424B | 25 mg 100 mg 250 mg | $214.00 $316.00 $418.00 | 7 | |
Ähnlich wie 5-Azacytidin wird Decitabin in die DNA eingebaut und hemmt die Methylierung, wodurch möglicherweise die ZIM3-Expression hochreguliert wird. | ||||||
L-Ascorbic acid, free acid | 50-81-7 | sc-202686 | 100 g | $45.00 | 5 | |
Vitamin C kann als Kofaktor für DNA-Demethylasen wirken und möglicherweise die Demethylierung von Genpromotoren, einschließlich der von ZIM3, stimulieren. | ||||||
Resveratrol | 501-36-0 | sc-200808 sc-200808A sc-200808B | 100 mg 500 mg 5 g | $60.00 $185.00 $365.00 | 64 | |
Als Modulator von Sirtuinen kann Resveratrol die Histondeacetylierungsmuster beeinflussen, was sich möglicherweise auf die ZIM3-Expression auswirkt. | ||||||
Trichostatin A | 58880-19-6 | sc-3511 sc-3511A sc-3511B sc-3511C sc-3511D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 50 mg | $149.00 $470.00 $620.00 $1199.00 $2090.00 | 33 | |
Dieser Histon-Deacetylase-Inhibitor kann die Acetylierung von Histonen erhöhen, wodurch die Transkription von ZIM3 möglicherweise hochreguliert wird. | ||||||
Genistein | 446-72-0 | sc-3515 sc-3515A sc-3515B sc-3515C sc-3515D sc-3515E sc-3515F | 100 mg 500 mg 1 g 5 g 10 g 25 g 100 g | $26.00 $92.00 $120.00 $310.00 $500.00 $908.00 $1821.00 | 46 | |
Als Phytoöstrogen hat Genistein nachweislich epigenetische Wirkungen, zu denen auch die Veränderung der Expression von geprägten Genen wie ZIM3 gehören könnte. | ||||||
Retinoic Acid, all trans | 302-79-4 | sc-200898 sc-200898A sc-200898B sc-200898C | 500 mg 5 g 10 g 100 g | $65.00 $319.00 $575.00 $998.00 | 28 | |
Ein Metabolit von Vitamin A, die Retinsäure, kann die Genexpression durch Aktivierung von Kernrezeptoren modulieren, was sich möglicherweise auf ZIM3 auswirkt. | ||||||
Sodium Butyrate | 156-54-7 | sc-202341 sc-202341B sc-202341A sc-202341C | 250 mg 5 g 25 g 500 g | $30.00 $46.00 $82.00 $218.00 | 19 | |
Durch Hemmung der Histondeacetylase kann Natriumbutyrat eine Hyperacetylierung von Histonen bewirken, was möglicherweise zu einer verstärkten ZIM3-Expression führt. | ||||||
Folic Acid | 59-30-3 | sc-204758 | 10 g | $72.00 | 2 | |
Folsäure ist für die DNA-Methylierungsprozesse unerlässlich; ihre Anwesenheit oder Abwesenheit kann den Methylierungsstatus und die Expression von Genen beeinflussen. | ||||||
Curcumin | 458-37-7 | sc-200509 sc-200509A sc-200509B sc-200509C sc-200509D sc-200509F sc-200509E | 1 g 5 g 25 g 100 g 250 g 1 kg 2.5 kg | $36.00 $68.00 $107.00 $214.00 $234.00 $862.00 $1968.00 | 47 | |
Curcumin ist dafür bekannt, dass es verschiedene Signalwege beeinflusst und möglicherweise epigenetische Wirkungen hat, die die Expression von Genen wie ZIM3 modulieren könnten. |