Rab 39 Aktivatoren

Gängige Rab 39 Activators sind unter underem Farnesyl pyrophosphate ammonium salt CAS 13058-04-3, Geranylgeranylpyrophosphate triammonium salt CAS 6699-20-3, Guanosine-5'-Triphosphate, Disodium salt CAS 86-01-1, Brefeldin A CAS 20350-15-6 und L-α-Lecithin, Egg Yolk, Highly Purified CAS 8002-43-5.

Zu den chemischen Aktivatoren von Rab 39 gehört eine Vielzahl von Verbindungen, die die Rolle des Proteins beim intrazellulären Transport erleichtern, indem sie seinen GTP-gebundenen aktiven Zustand aufrechterhalten oder seine posttranslationalen Modifikationen verbessern, die für die richtige Lokalisierung und Funktion erforderlich sind. GTPγS, ein nicht hydrolysierbares Analogon von GTP, fördert beispielsweise direkt die Aktivierung von Rab 39, indem es an das Protein bindet und die Hydrolyse von GTP verhindert, wodurch Rab 39 in seiner aktiven Form gehalten wird. Dies ist von entscheidender Bedeutung, da GTPasen wie Rab 39 die Bindung von GTP für ihre Aktivierung benötigen, und GTPγS stellt sicher, dass Rab 39 in diesem Zustand verbleibt, so dass es seine Rolle beim vesikulären Transport kontinuierlich erfüllen kann. In ähnlicher Weise bindet GTP selbst, der natürliche Ligand für GTPasen, an Rab 39 und löst die notwendige Konformationsänderung aus, die das Protein aktiviert. AlF4-, das das γ-Phosphat von GTP nachahmt, stabilisiert die GTPasen ebenfalls in ihrer aktiven Form, wodurch Rab 39 künstlich aktiv gehalten wird. Darüber hinaus erleichtern Magnesiumionen, die für die GTPase-Aktivierung unerlässlich sind, die GTP-Bindung an Rab 39 und ermöglichen dessen Aktivierung.

Darüber hinaus sind die Lipidmodifikationen von Rab 39 wesentlich für seine Aktivierung und Membranassoziation. Farnesylpyrophosphat und Geranylgeranylpyrophosphat dienen als Substrate für Enzyme, die die Addition von Farnesyl- bzw. Geranylgeranylgruppen an Rab 39 katalysieren. Diese Modifikationen sind notwendig, damit sich Rab 39 an Zellmembranen verankern und funktionell aktiv werden kann. Phosphatidylserin, ein Phospholipid, trägt dazu bei, Rab 39 an Membranoberflächen zu binden, was eine Voraussetzung für seine Aktivität ist. Darüber hinaus kann Palmitoyl-CoA zur Lipidmodifikation von Rab 39 beitragen, was seine Bindung an Membranen und die anschließende Aktivierung erleichtert. Lithiumchlorid spielt eine Rolle bei der Verlängerung des aktiven Zustands von Rab 39, indem es GTPase-aktivierende Proteine (GAPs) hemmt, die normalerweise die Umwandlung von aktivem GTP-Rab 39 in seine inaktive GDP-gebundene Form beschleunigen. Durch die Hemmung der GAPs sorgt Lithiumchlorid indirekt dafür, dass Rab 39 über längere Zeiträume aktiv bleibt. Schließlich können spezifische GAP-Inhibitoren auch indirekt zu einer anhaltenden Aktivierung von Rab 39 führen, da sie die Inaktivierung der GTPase verhindern, so dass Rab 39 seine Funktion beim Vesikeltransport fortsetzen kann.