Tup1 アクチベーター

一般的なTup1活性化剤には、5-アザシチジン CAS 320-67-2、メチルメタンスルホネート CAS 66-27-3、過酸化水素 CAS 7722-84-1、無水塩化カドミウム CAS 10108-64-2、リチウム CAS 7439-93-2などがあるが、これらに限定されない。

Tup1アクチベーターという名称は、サッカロマイセス・セレビシエ（Saccharomyces cerevisiae）のような酵母の一般的なコアプレッサーであるTup1と相互作用し、その機能を増強する分子のクラスに関するものである。Tup1はSsn6とともに複合体を形成し、グルコース抑制、交配型、嫌気性増殖に応答する遺伝子を含む様々な遺伝子の抑制に関与している。Tup1-Ssn6複合体は、DNAに結合したリプレッサーと相互作用することで機能し、転写装置がアクセスしにくい局所的なクロマチン構造を作り、それによって遺伝子発現をサイレンシングする。Tup1の活性化因子は、Tup1-Ssn6複合体の抑制活性を高めると考えられる。おそらく複合体自体を安定化させるか、DNAとの相互作用を増強するか、あるいはさらなるクロマチン修飾因子のリクルートを促進することによってであろう。この増強は、Tup1標的遺伝子のより強固な抑制につながり、細胞内の転写制御をより厳密にコントロールすることを可能にするだろう。

クロマチンダイナミクスと遺伝子制御の複雑さを考慮すると、化学的見地から、Tup1活性化因子は多様な化合物群になる可能性が高い。これらの活性化剤は、Tup1タンパク質を高い特異性で標的とし、他の細胞タンパク質やプロセスを破壊することなく、Tup1タンパク質のリプレッサー機能を強調する形で相互作用するように設計される必要がある。これらの分子の開発は、Ssn6、DNA結合型リプレッサー、クロマチンとの相互作用を担うドメインを含む、Tup1の構造と機能の詳細な理解に基づいている。クライオ電子顕微鏡やX線結晶構造解析などの高度な技術を用いれば、Tup1タンパク質上の活性化因子との結合部位が明らかになるかもしれないし、核磁気共鳴（NMR）分光法を用いれば、Tup1-Ssn6相互作用のダイナミクスに関する知見が得られるかもしれない。このような構造情報に助けられて、合理的薬物設計とコンビナトリアルケミストリーのアプローチを組み合わせて、活性化剤の候補を合成することができる。