TRM61 Inhibitoren

Gängige TRM61 Inhibitors sind unter underem Sinefungin CAS 58944-73-3, 5-Azacytidine CAS 320-67-2, Homocysteine CAS 6027-13-0, 5′-Deoxy-5′-methylthioadenosine CAS 2457-80-9 und 5-Aza-2′-Deoxycytidine CAS 2353-33-5.

TRM61-Inhibitoren beziehen sich auf eine Klasse von Verbindungen, die indirekt die Aktivität des TRM61-Proteins, einer Untereinheit des tRNA-Methyltransferase-Komplexes, hemmen können. Diese Inhibitoren wirken, indem sie auf verschiedene Phasen des tRNA-Modifizierungsprozesses abzielen oder indem sie die allgemeine Methylierungsmaschinerie in der Zelle stören. Die aufgelisteten Verbindungen sind keine direkten Inhibitoren von TRM61, können aber die Funktion des Proteins beeinflussen, indem sie die Substratverfügbarkeit verändern oder verwandte enzymatische Aktivitäten hemmen.

Verbindungen wie Adenosinperiodat und 5-Azacytidin können das Substrat (tRNA) so verändern, dass seine Erkennung durch TRM61 verändert wird, was eine ordnungsgemäße Methylierung verhindern kann. Sinefungin und Neplanocin A sind Nukleosidanaloga, die Methyltransferase-Enzyme im Allgemeinen hemmen, wozu auch Enzyme wie TRM61 gehören können. SAH und MTA sind Feedback-Inhibitoren; sie sind Produkte oder Nebenprodukte der Methylierungsreaktion, die Methyltransferasen, einschließlich TRM61, hemmen können, indem sie das aktive Zentrum des Enzyms besetzen. Andere Verbindungen wie BIX-01294 und RG108 sind dafür bekannt, dass sie DNA-Methyltransferasen hemmen, und aufgrund der Ähnlichkeit der katalytischen Mechanismen könnten sie auch RNA-Methyltransferasen hemmen. Decitabin und Zebularin sind Cytidin-Analoga, die sich in RNA und DNA einbauen können und damit möglicherweise Methylierungsprozesse insgesamt hemmen, was sich indirekt auf die Aktivität von TRM61 auswirken kann. Darüber hinaus hemmen Verbindungen wie 3-Deazaneplanocin A das Enzym S-Adenosylhomocystein-Hydrolase, was zur Anhäufung von SAH, einem starken Produktinhibitor von Methyltransferasen, führt und damit die TRM61-Aktivität hemmt. Cycloleucin kann die Synthese von S-Adenosylmethionin (SAM), dem primären Methyl-Donor für Methylierungsreaktionen, hemmen und dadurch die Methylierungsaktivität von TRM61 beeinträchtigen.