전사인자 IIA(TFIIA)의 화학적 억제제는 다양한 메커니즘을 통해 전사 개시 과정에서 이 필수 단백질이 제대로 기능하지 못하도록 방해합니다. 트립토라이드는 프로모터 부위에서 전사 기계의 조립을 방지하여 핵심 수준에서 전사 활동을 방해하는 억제제 중 하나로, TFIIA가 DNA 복합체와 결합하는 것을 차단합니다. 마찬가지로 디스타마이신 B(DrB)는 DNA의 마이너 홈에 결합하여 TFIIA에 대한 물리적 장벽을 만들어 DNA 결합 부위에 대한 접근을 억제합니다. 이러한 작용은 전사 개시 복합체에서 TFIIA의 기능적 억제를 초래합니다. 액티노마이신 D는 전사 개시 복합체 부위에서 DNA에 인터칼레이팅하여 RNA 중합 효소 II를 방해함으로써 억제 효과를 발휘하고 결과적으로 TFIIA가 개시하는 데 관여하는 RNA 사슬의 연장을 방해합니다. 또 다른 DNA 인터칼레이팅제인 미톡산트론도 DNA 파손을 일으키고 전사 과정을 방해하여 TFIIA 기능을 저해합니다.
DNA 부가체와 가교를 형성하는 옥살리플라틴도 마찬가지로 DNA 구조를 변경하고 전사 개시에 필요한 복합체 형성을 방지함으로써 TFIIA 기능에 영향을 미칩니다. α-아마니틴은 RNA 중합 효소 II를 표적으로 하여 전사 개시에서 TFIIA의 역할을 간접적으로 억제함으로써 이 효소가 보조하는 메커니즘을 방해합니다. 에토포사이드와 캠토테신은 각각 토포이소머라제 II와 I을 표적으로 하여 DNA 손상과 DNA-토포이소머라제 복합체의 안정화를 유도하여 TFIIA가 효과적으로 기능하는 데 필요한 DNA 풀림을 방지합니다. 뉴클레오사이드 유사체인 코디세핀은 RNA 사슬 신장을 조기에 종료하여 전사 과정을 중단시킴으로써 간접적으로 TFIIA를 억제합니다. 플라보피리돌은 프로모터-근위부 일시 정지 부위를 넘어 전사 연장에 필요한 P-TEFb 복합체의 일부인 CDK9를 억제하여 TFIIA가 활성화된 곳에서 전사 개시를 줄입니다. 마지막으로 브레펠딘 A는 세포 내 이동을 방해하여 필수 전사 인자 및 보조 인자의 수송 및 국소화에 영향을 미침으로써 간접적으로 TFIIA 억제를 유도합니다.
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