Os inibidores químicos de Sar1 podem perturbar o seu papel no tráfico de vesículas através de vários mecanismos. A brefeldina A, por exemplo, tem como alvo o fator de ADP-ribosilação (ARF), uma GTPase necessária para a formação de vesículas a partir do retículo endoplasmático (ER), que é crucial para a função de Sar1. Ao inibir o ARF, a Brefeldina A interrompe eficazmente a função de Sar1, interrompendo o transporte de vesículas numa fase precoce. Do mesmo modo, a Golgicida A e a Exo1 concentram-se na inibição do fator 1 de resistência BFA do Golgi (GBF1) e do domínio Sec7 do GBF1, respetivamente. Tanto o GBF1 como o seu domínio Sec7 são essenciais para a ativação do ARF, fundamental para a formação das vesículas COPI. Esta prevenção da ativação de ARF afecta indiretamente Sar1, uma vez que o seu papel está interligado com a função de ARF no transporte de vesículas.
Além disso, inibidores como H89 e SecinH3 actuam em reguladores a montante que influenciam a atividade de Sar1. O H89 impede a proteína quinase A, conhecida por fosforilar proteínas que regulam o Sar1, diminuindo assim indiretamente a atividade do Sar1 através da redução da função das proteínas reguladoras. A SecinH3 tem como alvo as citoesinas, uma família de factores de troca de nucleótidos de guanina (GEF) do ARF, o que leva a uma redução do tráfico relacionado com Sar1, impedindo os processos relacionados com o ARF. Por outro lado, o AG1478, o MiTMAB e o Dynasore afectam a função Sar1, alterando os processos periféricos da formação de vesículas COPI. O AG1478, um inibidor da tirosina quinase, pode alterar as vias de sinalização celular que influenciam a formação de vesículas, afectando assim indiretamente o Sar1. O MiTMAB e o Dynasore perturbam a função da dynamin, uma GTPase envolvida na cisão de vesículas, que é um passo subsequente à formação de vesículas onde Sar1 actua. Finalmente, ML141, CASIN, Latrunculina B e Citocalasina D perturbam o citoesqueleto de actina, que desempenha um papel no transporte de vesículas. O ML141 e a CASIN inibem a Cdc42, uma GTPase envolvida na formação de filamentos de actina, enquanto a Latrunculina B e a Citocalasina D impedem a polimerização da actina e promovem a despolimerização, respetivamente. Estas perturbações no citoesqueleto podem afetar indiretamente o papel da Sar1 no transporte de vesículas.
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