Los inhibidores químicos de la Ppat incluyen una variedad de compuestos que se dirigen a diferentes aspectos de la biosíntesis y el metabolismo de nucleótidos, reduciendo así indirectamente la actividad funcional de la Ppat. El metotrexato, un conocido inhibidor de la dihidrofolato reductasa, provoca una disminución de los niveles de nucleótidos de purina, que son sustratos cruciales para la actividad de la Ppat en la síntesis de ácidos nucleicos. Del mismo modo, tanto el ácido micofenólico como la ribavirina inhiben la inosina monofosfato deshidrogenasa, una enzima fundamental para la producción de nucleótidos de guanina, disminuyendo así la disponibilidad de sustratos para la acción de la Ppat. La clofarabina y la fludarabina actúan sobre la ribonucleótido reductasa, una enzima responsable de la reducción de los ribonucleótidos a desoxinucleótidos, que son esenciales para la síntesis del ADN y los mecanismos de reparación en los que participa el Ppat. La cladribina y la hidroxiurea también inhiben la ribonucleótido reductasa, pero a través de interacciones moleculares diferentes, aunque convergen en el resultado de reducir las reservas de desoxinucleótidos trifosfato, lo que afecta indirectamente a la actividad de la Ppat.
La sustancia química Tiazofurina reduce los niveles de NAD, una coenzima necesaria para muchas reacciones enzimáticas, incluidas aquellas en las que participa la Ppat, inhibiendo así indirectamente la enzima. Los análogos de las purinas, como la 6-mercaptopurina y la 6-tioguanina, se incorporan a los ácidos nucleicos e interrumpen el metabolismo de las purinas, lo que a su vez reduce la actividad de la Ppat al limitar la disponibilidad de sus sustratos. El aciclovir, una vez fosforilado a su forma activa trifosfato, inhibe la ADN polimerasa, lo que conduce a una reducción de las reservas de nucleótidos y, en consecuencia, de la actividad de la Ppat debido a la escasez de sustratos. Por último, la Gemcitabina, otro nucleósido análogo, inhibe la ribonucleótido reductasa, disminuyendo así las reservas de nucleótidos necesarias para que la Ppat funcione eficazmente en la biosíntesis de ácidos nucleicos. Cada uno de estos productos químicos, a través de sus distintas interacciones bioquímicas, convergen en un resultado común de la reducción de los niveles de nucleótidos y la disponibilidad, que es esencial para la actividad de Ppat, en última instancia, dando lugar a su inhibición funcional.
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