Gli attivatori di KRBOX1 sono una classe di composti chimici progettati per potenziare selettivamente l'attività di KRBOX1, una proteina caratterizzata dalla presenza di un dominio KRAB (Kruppel-associated box) e di una sequenza BOX1. Il dominio KRAB si trova tipicamente in una famiglia di proteine zinc finger ed è noto per il suo ruolo nella repressione trascrizionale, suggerendo che KRBOX1 possa essere coinvolta nei processi di regolazione genica all'interno del nucleo. Le funzioni specifiche di KRBOX1, in particolare nel contesto della sua sequenza BOX1, rimangono un'area di ricerca in corso, ma si pensa che abbia un ruolo nel legame con il DNA o nelle interazioni proteina-proteina, contribuendo alle sue capacità regolatorie. Lo sviluppo di attivatori di KRBOX1 mira a modulare l'attività di questa proteina, influenzando potenzialmente la regolazione trascrizionale dei geni sotto il suo controllo. Questi attivatori sono sintetizzati attraverso processi chimici avanzati, con l'obiettivo di produrre molecole in grado di interagire con KRBOX1 in modo da potenziare le sue funzioni regolatorie naturali. Ciò comporta una profonda comprensione della struttura della proteina, compresi i suoi domini di legame con il DNA e le regioni regolatorie che potrebbero essere prese di mira per influenzare l'attività di KRBOX1 nella modulazione dell'espressione genica.
L'esplorazione degli attivatori di KRBOX1 prevede un approccio multidisciplinare, che integra metodologie di biologia molecolare, biochimica e biologia strutturale per chiarire l'interazione tra questi composti e la proteina KRBOX1. Per studiare l'impatto degli attivatori sulla capacità di KRBOX1 di legare il DNA e regolare l'espressione genica, vengono impiegate tecniche come i saggi di immunoprecipitazione della cromatina (ChIP) e i saggi dei geni reporter. Inoltre, le tecniche di espressione e purificazione della proteina, insieme ai saggi di legame in vitro, sono fondamentali per valutare l'interazione diretta tra KRBOX1 e i suoi attivatori. Gli studi strutturali, tra cui la cristallografia a raggi X e la spettroscopia di risonanza magnetica nucleare (NMR), forniscono approfondimenti sulla struttura tridimensionale di KRBOX1, identificando i potenziali siti di legame con gli attivatori e delucidando i cambiamenti conformazionali associati all'attivazione. La modellazione computazionale e il docking molecolare aiutano ulteriormente a comprendere le dinamiche di interazione tra KRBOX1 e i potenziali attivatori, guidando la progettazione razionale e l'ottimizzazione di queste molecole per una maggiore efficacia e specificità. Attraverso questo quadro di ricerca completo, lo studio degli attivatori di KRBOX1 mira a contribuire alla comprensione dei meccanismi molecolari della regolazione trascrizionale e del ruolo di KRBOX1 nel controllo dell'espressione genica, facendo progredire il campo della regolazione genica e della biologia molecolare.
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Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
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5-Azacytidine | 320-67-2 | sc-221003 | 500 mg | $280.00 | 4 | |
Un inibitore della DNA metiltransferasi che potrebbe potenzialmente upregolare i geni silenziati dalla metilazione del DNA. | ||||||
Trichostatin A | 58880-19-6 | sc-3511 sc-3511A sc-3511B sc-3511C sc-3511D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 50 mg | $149.00 $470.00 $620.00 $1199.00 $2090.00 | 33 | |
Un inibitore dell'HDAC che può aumentare l'acetilazione degli istoni, con possibile upregolazione di alcuni geni. | ||||||
Suberoylanilide Hydroxamic Acid | 149647-78-9 | sc-220139 sc-220139A | 100 mg 500 mg | $130.00 $270.00 | 37 | |
Un altro inibitore HDAC che può portare a un aumento dell'acetilazione degli istoni e a una potenziale attivazione genica. | ||||||
Valproic Acid | 99-66-1 | sc-213144 | 10 g | $85.00 | 9 | |
È un inibitore di HDAC con il potenziale di alterare l'espressione genica attraverso cambiamenti nell'acetilazione degli istoni. | ||||||
Mithramycin A | 18378-89-7 | sc-200909 | 1 mg | $54.00 | 6 | |
Un composto in grado di legarsi alle regioni ricche di GC del DNA, influenzando potenzialmente il legame dei fattori di trascrizione. | ||||||
Disulfiram | 97-77-8 | sc-205654 sc-205654A | 50 g 100 g | $52.00 $87.00 | 7 | |
Un inibitore delle metiltransferasi del DNA, che potrebbe ipoteticamente portare alla demetilazione e all'attivazione genica. | ||||||
Genistein | 446-72-0 | sc-3515 sc-3515A sc-3515B sc-3515C sc-3515D sc-3515E sc-3515F | 100 mg 500 mg 1 g 5 g 10 g 25 g 100 g | $26.00 $92.00 $120.00 $310.00 $500.00 $908.00 $1821.00 | 46 | |
Un inibitore della tirosin-chinasi, che può influenzare le vie di segnalazione e potenzialmente l'espressione genica. | ||||||
5-Aza-2′-Deoxycytidine | 2353-33-5 | sc-202424 sc-202424A sc-202424B | 25 mg 100 mg 250 mg | $214.00 $316.00 $418.00 | 7 | |
Un agente ipometilante che potrebbe portare all'upregulation di geni silenziati dalla metilazione. | ||||||
RG 108 | 48208-26-0 | sc-204235 sc-204235A | 10 mg 50 mg | $128.00 $505.00 | 2 | |
Un inibitore della DNA metiltransferasi che può impedire la metilazione dei promotori genici per attivare la trascrizione. | ||||||
Zebularine | 3690-10-6 | sc-203315 sc-203315A sc-203315B | 10 mg 25 mg 100 mg | $126.00 $278.00 $984.00 | 3 | |
Un analogo della citidina che può incorporarsi nel DNA e inibire la metilazione del DNA, influenzando potenzialmente l'espressione genica. |