GalNAc-T13 Inhibitoren

Gängige GalNAc-T13 Inhibitors sind unter underem Manganese(II) chloride beads CAS 7773-01-5, Ubiquinol CAS 992-78-9, 2-Deoxy-D-glucose CAS 154-17-6, Tunicamycin CAS 11089-65-9 und Brefeldin A CAS 20350-15-6.

Die chemische Klasse der GalNAc-T13-Inhibitoren umfasst Verbindungen, die das GalNAc-T13-Protein hemmen können. GalNAc-T13 ist eine Art Glykosyltransferase, ein Enzym, das für die Übertragung von N-Acetylgalaktosamin auf die Hydroxylgruppen von Serin- oder Threoninresten im ersten Schritt der O-gebundenen Glykosylierung vom Mucin-Typ verantwortlich ist. Die Hemmung dieses Proteins kann durch verschiedene Mechanismen erfolgen, darunter Substratkonkurrenz, allosterische Hemmung, Rückkopplungshemmung und Störung notwendiger Kofaktoren oder zellulärer Prozesse.

Verbindungen wie Benzyl-α-GalNAc können mit dem natürlichen Substrat um die Bindung an das aktive Zentrum konkurrieren und so die Fähigkeit des Enzyms, seine Reaktion zu katalysieren, wirksam verringern. ST045849 gehört zur Klasse der allosterischen Inhibitoren, die an eine andere Stelle des Enzyms als die aktive Stelle binden und so eine Konformationsänderung bewirken, die die Aktivität des Enzyms beeinträchtigt. Feedback-Inhibitoren wie UDP können sich nach der Freisetzung aus dem aktiven Zentrum des Enzyms an das Enzym binden, was zu einer Abnahme der Enzymaktivität führt. Darüber hinaus kann die für die Aktivität des Enzyms entscheidende Metallionenumgebung durch Verbindungen wie MnCl2 verändert werden, die mit essenziellen Metall-Cofaktoren einen Komplex bilden können. Darüber hinaus kann die Funktion von GalNAc-T13 indirekt gehemmt werden, indem der Gehalt an seinen Substraten oder Cofaktoren beeinflusst wird. Decylubiquinon und 2-Deoxy-D-Glucose können den Gehalt an UTP und UDP-GalNAc verringern, die für die Glykosyltransferase-Aktivität von GalNAc-T13 erforderlich sind. Tunicamycin, Brefeldin A, Castanospermin, Swainsonin, Deoxynojirimycin und Kifunensin sind Inhibitoren der Glykoproteinsynthese und der Verarbeitungswege. Diese Verbindungen können die ordnungsgemäße Faltung, Verarbeitung oder Lokalisierung von Glykoproteinen stören, was sich indirekt auf die Funktion von GalNAc-T13 auswirken kann, da die Aktivität des Enzyms eng mit dem Glykosylierungsstatus von Proteinen im Golgi verbunden ist.