DUX5活性化剤は、DUX5という遺伝子によってコードされるタンパク質の活性を調節するように特別に設計された化合物群であろう。DUX5がダブルホメオボックス(DUX)ファミリーのメンバーであると仮定すると、これらのタンパク質はしばしばゲノム制御の役割を果たし、他の遺伝子の発現に影響を与える。したがって、この文脈における活性化因子は、DUX5と相互作用して、標的遺伝子を制御するその能力を高めることになる。これには、DNA結合親和性を高める、核局在化を促進する、補因子との相互作用を促進する、あるいはタンパク質の分解を防ぐために安定化させる、などが考えられる。このクラスの分子は、DUX5に対して高度な特異性を示し、構造的に多様で、タンパク質の特徴的なドメインに結合するように調整され、DUX5の天然の活性化メカニズムを模倣したり促進したりするように設計されるかもしれない。
DUX5活性化因子の探索と設計は、詳細な分子生物学と化学に基づいた複雑なプロセスであろう。研究者はまず、DNA結合ドメイン、転写活性化領域、活性を制御する翻訳後修飾など、DUX5タンパク質の構造と制御メカニズムを明らかにすることから始める。これらの側面を理解することは、DUX5タンパク質の機能を増強するような相互作用が可能な分子を合理的にデザインする上で重要である。発見段階に続いて、潜在的な活性化因子が合成され、一連の生化学的アッセイによって評価される。これには、DUX5とそのDNA標的との相互作用の増強を評価するDNA結合試験、共制御タンパク質との相互作用を調べる共免疫沈降法、DUX5の制御下にある遺伝子のアップレギュレーションを測定するレポーターアッセイなどが含まれる。表面プラズモン共鳴(SPR)や等温滴定カロリメトリー(ITC)のような高度な分析技術を用いれば、DUX5に対する活性化因子の相互作用速度や親和性を定量化することができる。さらに、核磁気共鳴(NMR)分光法やX線結晶構造解析を用いた構造研究によって、DUX5タンパク質上の活性化因子によって誘導される結合部位や構造変化を明らかにすることができる。このような包括的な特性解析により、活性化因子の分子間相互作用と、その結果生じるDUX5の機能への影響について、より深い理解が得られるであろう。
製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
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Retinoic Acid, all trans | 302-79-4 | sc-200898 sc-200898A sc-200898B sc-200898C | 500 mg 5 g 10 g 100 g | $65.00 $319.00 $575.00 $998.00 | 28 | |
発生と遺伝子発現の制御に関与するレチノイン酸は、DUX5のような発生に関与する遺伝子の発現に影響を与えるかもしれない。 | ||||||
5-Aza-2′-Deoxycytidine | 2353-33-5 | sc-202424 sc-202424A sc-202424B | 25 mg 100 mg 250 mg | $214.00 $316.00 $418.00 | 7 | |
脱メチル化剤として、DUX5のような発生に関与する遺伝子を含む、サイレンシングされた遺伝子を再活性化する可能性がある。 | ||||||
Trichostatin A | 58880-19-6 | sc-3511 sc-3511A sc-3511B sc-3511C sc-3511D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 50 mg | $149.00 $470.00 $620.00 $1199.00 $2090.00 | 33 | |
ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤で、クロマチンアクセシビリティを変化させ、DUX5などの発生遺伝子の発現に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Harmine | 442-51-3 | sc-202644 sc-202644A sc-202644B sc-202644C sc-202644D sc-202644E sc-202644F | 250 mg 500 mg 1 g 10 g 50 g 100 g 500 g | $52.00 $102.00 $124.00 $540.00 $1438.00 $2560.00 $11230.00 | 2 | |
Wnt/β-カテニンシグナル伝達経路を活性化することで、DUX5を含む発生に関与する遺伝子の発現を変化させる可能性がある。 | ||||||
Lithium | 7439-93-2 | sc-252954 | 50 g | $214.00 | ||
GSK-3阻害剤はWntシグナルを活性化し、DUX5を含む発生制御遺伝子の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Folic Acid | 59-30-3 | sc-204758 | 10 g | $72.00 | 2 | |
DNA合成と細胞分裂に不可欠な葉酸は、発育初期の遺伝子発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Dexamethasone | 50-02-2 | sc-29059 sc-29059B sc-29059A | 100 mg 1 g 5 g | $76.00 $82.00 $367.00 | 36 | |
グルココルチコイドとして、遺伝子発現を制御することができ、DUX5のような発生と分化に関与する遺伝子に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Cholecalciferol | 67-97-0 | sc-205630 sc-205630A sc-205630B | 1 g 5 g 10 g | $70.00 $160.00 $290.00 | 2 | |
ビタミンD3は、その活性代謝物を通して、発生過程で制御される遺伝子を含む遺伝子発現に影響を与えることができる。 |