Os activadores do CCDC139 são um grupo diversificado de compostos químicos que têm o potencial de aumentar a atividade funcional do CCDC139 através de diferentes vias bioquímicas. Sabe-se que a forskolina e o IBMX, por exemplo, aumentam os níveis intracelulares de AMPc, o que, por sua vez, ativa a proteína quinase A (PKA). Se o CCDC139 for um substrato para a PKA ou estiver envolvido na sinalização dependente de AMPc, estes compostos poderão levar à sua ativação. Do mesmo modo, ao aumentar os níveis de cálcio intracelular, a isonomicina e o A23187 poderiam ativar vias de sinalização dependentes do cálcio que podem envolver o CCDC139. O PMA, um conhecido ativador da PKC, poderá aumentar a atividade da CCDC139 se a fosforilação dependente da PKC fizer parte da sua regulação. Além disso, o galato de epigalocatequina (EGCG) funciona como um inibidor da quinase e pode levar à ativação da CCDC139 através da inibição de cinases que, de outra forma, regulam negativamente a proteína ou as suas vias.
Além disso, o LY294002 e o U0126, inibidores da PI3K e da MEK, respetivamente, poderiam ativar indiretamente a CCDC139 alterando as vias PI3K/Akt e MAPK/ERK, partindo do princípio de que a atividade da CCDC139 é modulada por estas vias. O SB203580, um inibidor da p38 MAPK, e a anisomicina, um ativador da JNK, podem afetar a CCDC139, quer alterando a dinâmica da sinalização a favor das vias que activam a CCDC139, quer activando a sinalização da JNK, da qual a CCDC139 poderia fazer parte. A esfingosina-1-fosfato (S1P) liga-se aos receptores acoplados à proteína G e inicia cascatas de sinalização que podem incluir o CCDC139, se este estiver de facto envolvido nas vias que respondem à S1P. A genisteína, ao inibir as tirosina-cinases, pode remover a inibição competitiva de outras vias, levando potencialmente à ativação da CCDC139 se esta estiver sob a influência reguladora da sinalização da tirosina-cinase. Coletivamente, estes activadores químicos, através da sua influência direccionada sobre as vias de sinalização celular, oferecem um espetro de mecanismos que podem levar a uma maior atividade funcional da CCDC139 sem necessariamente aumentar a sua expressão ou exigir uma interação direta com a proteína.
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