C20orf95活性化剤とは、染色体20上に位置するヒト遺伝子C20orf95によってコードされるタンパク質の機能を増強するようにデザインされた、理論的な化学薬剤群を指す。C20orf95のorfはオープンリーディングフレームを意味し、この遺伝子がタンパク質をコードする可能性が認められていることを示している。このことから、C20orf95の活性化因子は、タンパク質の活性コンフォメーションを安定化させる直接結合、タンパク質間相互作用の促進、あるいは転写レベルでのアップレギュレーションによるタンパク質の発現の増強によって、タンパク質と特異的に相互作用し、その本来の活性を高める分子であると考えられる。このような活性化因子の設計には、特異性を確保し、他のタンパク質との相互作用から生じる標的外効果を避けるために、タンパク質の構造と機能を詳細に理解する必要がある。
C20orf95活性化因子の開発は、細胞内でのC20orf95タンパク質の構造と役割を解明する包括的な研究から始める多面的な努力となるであろう。構造生物学者は、X線結晶構造解析、クライオ電子顕微鏡、NMR分光法などの高度なイメージング技術を利用して、タンパク質の3次元立体構造を決定し、活性化化合物との潜在的結合部位を明らかにすることができるであろう。この構造的な洞察は、化学者がタンパク質上の特定の部位と相互作用するように設計された様々な低分子を合成する、医薬品化学の取り組みの指針となる。これらの低分子化合物とC20orf95タンパク質との相互作用は、表面プラズモン共鳴や蛍光ベースの熱シフトアッセイなど、結合親和性や特異性を測定する様々なin vitroアッセイを用いて評価することができる。これらの研究は、細胞内または生化学的な状況におけるタンパク質の活性の増加を測定する機能的アッセイによって補完されるであろう。細胞ベースのアッセイによって、これらの活性化因子が細胞内のタンパク質のレベルにどのような影響を与えるかについての情報をさらに得ることができ、レポーター遺伝子を用いたり、ウェスタンブロッティングやELISAなどのタンパク質定量法を用いたりすることができる。これらの構造解析と機能解析を統合することで、C20orf95活性化因子が標的タンパク質とどのように相互作用し、その結果どのような生化学的結果がもたらされるのかについて、研究者たちは微妙な理解を深めることができるであろう。
関連項目
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製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
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Lovastatin | 75330-75-5 | sc-200850 sc-200850A sc-200850B | 5 mg 25 mg 100 mg | $28.00 $88.00 $332.00 | 12 | |
スタチンはイソプレノイド経路、ひいてはRho GTPase活性に影響を与え、RhoGAPの発現を変化させる可能性がある。 | ||||||
Y-27632, free base | 146986-50-7 | sc-3536 sc-3536A | 5 mg 50 mg | $182.00 $693.00 | 88 | |
RhoA GTPaseの下流で働くROCK阻害剤は、間接的にRhoGAPの発現に影響を与えるかもしれない。 | ||||||
CCG-1423 | 285986-88-1 | sc-205241 sc-205241A | 1 mg 5 mg | $30.00 $90.00 | 8 | |
この化合物はRhoAを介するSRF転写を阻害し、RhoGAP発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
ML 141 | 71203-35-5 | sc-362768 sc-362768A | 5 mg 25 mg | $134.00 $502.00 | 7 | |
Cdc42 GTPaseの選択的阻害剤であり、Rho GTPase経路内のクロストークを通じてRhoGAP発現に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Lithium | 7439-93-2 | sc-252954 | 50 g | $214.00 | ||
GSK-3βシグナル伝達に影響を与え、RhoGAPを含む遺伝子発現プロファイルに影響を与える可能性がある。 | ||||||
(−)-Epigallocatechin Gallate | 989-51-5 | sc-200802 sc-200802A sc-200802B sc-200802C sc-200802D sc-200802E | 10 mg 50 mg 100 mg 500 mg 1 g 10 g | $42.00 $72.00 $124.00 $238.00 $520.00 $1234.00 | 11 | |
ポリフェノールはシグナル伝達経路を調節し、RhoGAPの発現を変化させる可能性がある。 | ||||||
LY 294002 | 154447-36-6 | sc-201426 sc-201426A | 5 mg 25 mg | $121.00 $392.00 | 148 | |
Aktシグナル伝達に影響を与え、それによってRhoGAPの発現を調節しうるPI3K阻害剤である。 | ||||||
PD 98059 | 167869-21-8 | sc-3532 sc-3532A | 1 mg 5 mg | $39.00 $90.00 | 212 | |
MAPK経路の一部であるMEKの阻害剤は、RhoGAPの発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
SB 203580 | 152121-47-6 | sc-3533 sc-3533A | 1 mg 5 mg | $88.00 $342.00 | 284 | |
p38 MAPK阻害剤は、細胞のストレス応答、ひいてはRhoGAPの発現に影響を及ぼすかもしれない。 | ||||||
U-0126 | 109511-58-2 | sc-222395 sc-222395A | 1 mg 5 mg | $63.00 $241.00 | 136 | |
MEK1/2の選択的阻害剤であり、MAPK経路の調節を通じてRhoGAPの発現を変化させる可能性がある。 |