A ação dos inibidores do BAF57 centrar-se-ia na perturbação da função normal do complexo SWI/SNF. Isto pode ser conseguido alterando a conformação do BAF57, impedindo a sua incorporação no complexo ou bloqueando os seus locais de interação. Por exemplo, uma molécula que imite a estrutura do ADN ou das histonas pode ligar-se ao BAF57, inibindo assim competitivamente a sua função normal no processo de remodelação da cromatina. Em alternativa, um composto poderia ligar-se ao domínio ATPase das proteínas BRG1 ou hBRM associadas, que são essenciais para a remodelação da cromatina dependente de energia, impedindo assim indiretamente o BAF57 de exercer o seu papel no processo.
Estes inibidores actuariam essencialmente no sentido de impedir o recrutamento do complexo SWI/SNF para os genes-alvo, ou de travar a atividade de remodelação do complexo, levando a alterações nos padrões de expressão genética. A especificidade necessária para inibir seletivamente o BAF57 no complexo SWI/SNF representa um desafio significativo, uma vez que o complexo é conhecido pela sua composição dinâmica e pela multiplicidade de interacções com várias proteínas e regiões do ADN. Consequentemente, a conceção de tais inibidores exigiria uma compreensão profunda da biologia estrutural do BAF57 e do funcionamento intrincado do processo de remodelação da cromatina. De um modo geral, os inibidores do BAF57 representariam uma classe de compostos com capacidade para modular a expressão genética, visando diretamente a maquinaria de remodelação da cromatina ao nível da atividade e das interacções do BAF57 no núcleo da célula.
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