Gli attivatori di A230083H22Rik comprendono un gruppo di entità chimiche in grado di avviare o aumentare l'attività del gene A230083H22Rik. Per individuare questi attivatori, gli scienziati impiegano un approccio di screening high-throughput (HTS), che consente di valutare rapidamente numerosi composti per la loro capacità di modulare l'espressione genica. Questo metodo prevede un sistema di saggio del gene reporter in cui un gene reporter, come quello che codifica per una proteina fluorescente o luminescente, è posto sotto il controllo del promotore A230083H22Rik. L'applicazione di una libreria chimica a cellule contenenti questo costrutto produce un segnale misurabile quando il promotore è attivato, che è indicativo della capacità del composto di potenziare l'attività del gene. Un segnale più forte corrisponde a una maggiore attività del promotore, identificando così le sostanze chimiche che possono agire come attivatori del gene A230083H22Rik. Questi risultati primari sono destinati a un'ulteriore convalida per garantire che aumentino realmente l'attività del gene e non siano falsi positivi, una fase cruciale del processo di identificazione.
La validazione di questi attivatori preliminari prevede un processo in due fasi. Il primo passo è la PCR quantitativa (qPCR), che quantifica la quantità di mRNA prodotta dal gene A230083H22Rik in presenza dei composti. Un aumento del livello di mRNA è una chiara indicazione che un composto può attivare la trascrizione del gene. Per confermare che questa attivazione trascrizionale porta a un aumento del livello di proteine, si esegue la seconda fase, l'analisi Western blot. Questa tecnica prevede la separazione delle proteine mediante elettroforesi su gel, il loro trasferimento su una membrana specializzata e la successiva rilevazione mediante anticorpi specifici contro la proteina A230083H22Rik. Un attivatore efficace mostrerà un segnale più forte sul Western blot per la proteina A230083H22Rik rispetto ai campioni di controllo non trattati. Questo aumento conferma che il composto non solo aumenta i livelli di mRNA, ma migliora anche la sintesi della proteina corrispondente.
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| Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
|---|---|---|---|---|---|---|
PMA | 16561-29-8 | sc-3576 sc-3576A sc-3576B sc-3576C sc-3576D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 100 mg | $40.00 $129.00 $210.00 $490.00 $929.00 | 119 | |
Il PMA è un potente attivatore della protein chinasi C (PKC). La fosforilazione della PKC può portare all'attivazione di proteine a valle o all'interno dello stesso percorso di A230083H22Rik, potenzialmente potenziando l'attività di A230083H22Rik attraverso sistemi di messaggeri secondari. | ||||||
Ionomycin, free acid | 56092-81-0 | sc-263405 sc-263405A | 1 mg 5 mg | $94.00 $259.00 | 2 | |
La ionomicina è uno ionoforo di calcio che aumenta la concentrazione di calcio intracellulare, attivando potenzialmente le chinasi calcio-dipendenti come la chinasi calmodulina-dipendente (CaMK), che potrebbe potenziare l'attività di A230083H22Rik se fa parte di una via di segnalazione calcio-dipendente. | ||||||
(−)-Epigallocatechin Gallate | 989-51-5 | sc-200802 sc-200802A sc-200802B sc-200802C sc-200802D sc-200802E | 10 mg 50 mg 100 mg 500 mg 1 g 10 g | $42.00 $72.00 $124.00 $238.00 $520.00 $1234.00 | 11 | |
L'EGCG è una catechina presente nel tè verde con attività di inibizione delle chinasi. Può modulare diverse vie di segnalazione, portando potenzialmente a un'innalzamento dell'attività di A230083H22Rik inibendo le chinasi che altrimenti fosforilerebbero e inattiverebbero le proteine all'interno della via di A230083H22Rik. | ||||||
LY 294002 | 154447-36-6 | sc-201426 sc-201426A | 5 mg 25 mg | $121.00 $392.00 | 148 | |
LY294002 è un inibitore PI3K che può alterare il percorso PI3K/AKT. Inibendo PI3K, può portare all'attivazione di percorsi alternativi o al rilascio dell'inibizione su A230083H22Rik, se è regolato negativamente dalla segnalazione PI3K/AKT. | ||||||
SB 203580 | 152121-47-6 | sc-3533 sc-3533A | 1 mg 5 mg | $88.00 $342.00 | 284 | |
SB203580 è un inibitore di p38 MAPK che potrebbe spostare le dinamiche di segnalazione all'interno della cellula, potenzialmente potenziando l'attività di A230083H22Rik se fa parte di un percorso antagonista a p38 MAPK o regolato da proteine influenzate dall'attività di p38 MAPK. | ||||||
U-0126 | 109511-58-2 | sc-222395 sc-222395A | 1 mg 5 mg | $63.00 $241.00 | 136 | |
U0126 è un inibitore di MEK, che è a monte di ERK nel percorso MAPK. L'inibizione di MEK può portare all'attivazione di A230083H22Rik aumentando l'attività di vie di segnalazione alternative o riducendo la regolazione negativa esercitata dalla via MAPK. | ||||||
SP600125 | 129-56-6 | sc-200635 sc-200635A | 10 mg 50 mg | $40.00 $150.00 | 257 | |
Sp600125 è un inibitore di JNK, parte del percorso MAPK. Inibendo JNK, potrebbe alterare l'equilibrio di segnalazione della cellula, potenzialmente potenziando l'attività di A230083H22Rik se si trova all'interno di un percorso regolato da JNK o influenzato dall'attività di JNK. | ||||||
A23187 | 52665-69-7 | sc-3591 sc-3591B sc-3591A sc-3591C | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg | $54.00 $128.00 $199.00 $311.00 | 23 | |
L'A23187 è uno ionoforo di calcio simile alla ionomicina e aumenta i livelli di calcio intracellulare, il che potrebbe attivare A230083H22Rik attraverso vie di segnalazione calcio-dipendenti o indirettamente modulando l'attività di altre proteine calcio-dipendenti che interagiscono con A230083H22Rik. | ||||||
Zaprinast (M&B 22948) | 37762-06-4 | sc-201206 sc-201206A | 25 mg 100 mg | $103.00 $245.00 | 8 | |
Zaprinast è un inibitore selettivo della fosfodiesterasi 5 (PDE5), con conseguente aumento dei livelli di cGMP nella cellula. Il cGMP elevato può attivare la PKG, che potrebbe potenziare l'attività funzionale di A230083H22Rik attraverso la fosforilazione o i percorsi di segnalazione dipendenti dal cGMP. Mi scuso, ma senza il nome specifico della proteina fornito nelle istruzioni di denominazione, non posso completare la tabella con gli attivatori specifici per una particolare proteina. La prego di fornire il nome effettivo della proteina e il nome del gene, in modo da poter generare un elenco accurato di attivatori chimici per la proteina specificata. | ||||||