Os inibidores da HDAC2 são um grupo de compostos que têm como alvo a enzima histona desacetilase 2, um membro da família da histona desacetilase (HDAC). As histona desacetilases estão envolvidas na remoção de grupos acetilo dos resíduos de lisina das proteínas histonas, uma ação que está normalmente associada à condensação da cromatina e à repressão da transcrição genética. A HDAC2, em particular, desempenha um papel importante na modulação da expressão genética através da sua atividade de desacetilase, que altera a estrutura da cromatina e a acessibilidade dos factores de transcrição ao ADN. Os inibidores da HDAC2 são concebidos para se ligarem ao local ativo da enzima, obstruindo assim a sua atividade de desacetilase. Este bloqueio resulta num aumento do nível de acetilação das histonas, conduzindo a uma estrutura de cromatina mais aberta e mais ativa do ponto de vista da transcrição. A regulação dos estados de acetilação pelos inibidores da HDAC2 afecta os padrões de expressão de múltiplos genes, o que faz desta classe de compostos um foco de interesse no estudo da expressão e regulação génica.
Químicamente, os inibidores da HDAC2 são variados, englobando um leque de estruturas que vão desde os ácidos hidroxâmicos aos péptidos cíclicos e benzamidas, entre outros. Estes inibidores contêm normalmente um grupo de ligação ao zinco (ZBG) que interage com o ião zinco no local ativo da HDAC2. Esta interação é crucial para a ação inibitória destes compostos. Para além do ZBG, estas moléculas possuem frequentemente uma cadeia de ligação e um grupo "cap", que contribuem ambos para a afinidade do composto pela enzima e para a especificidade da HDAC2 em relação a outras enzimas HDAC. Pensa-se que o grupo "cap" interage com a superfície da enzima e pode conferir seletividade explorando as diferenças nos domínios exteriores da enzima. O ligante liga o grupo cap ao ZBG e é concebido para ocupar o espaço no sítio ativo tubular da enzima.
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