Les inhibiteurs d'HDAC2 sont un groupe de composés qui ciblent l'enzyme histone désacétylase 2, un membre de la famille des histones désacétylases (HDAC). Les histones désacétylases sont impliquées dans l'élimination des groupes acétyles des résidus lysine sur les protéines histones, une action qui est généralement associée à la condensation de la chromatine et à la répression de la transcription des gènes. HDAC2, en particulier, joue un rôle important dans la modulation de l'expression génétique grâce à son activité de désacétylase, qui modifie la structure de la chromatine et l'accessibilité des facteurs de transcription à l'ADN. Les inhibiteurs d'HDAC2 sont conçus pour se lier au site actif de l'enzyme, entravant ainsi son activité de désacétylase. Ce blocage entraîne une augmentation du niveau d'acétylation des histones, ce qui se traduit par une structure chromatinienne plus ouverte et plus active sur le plan de la transcription. La régulation des états d'acétylation par les inhibiteurs de HDAC2 affecte les schémas d'expression de plusieurs gènes, ce qui fait de cette classe de composés un centre d'intérêt dans l'étude de l'expression et de la régulation des gènes.
Chemiquement, les inhibiteurs de HDAC2 sont variés, englobant une gamme de structures allant des acides hydroxamiques aux peptides cycliques et aux benzamides, entre autres. Ces inhibiteurs contiennent généralement un groupe de liaison au zinc (ZBG) qui interagit avec l'ion zinc dans le site actif de HDAC2. Cette interaction est cruciale pour l'action inhibitrice de ces composés. Outre le ZBG, ces molécules possèdent souvent une chaîne de liaison et un groupe chapeau, qui contribuent tous deux à l'affinité du composé pour l'enzyme et à la spécificité de l'HDAC2 par rapport à d'autres enzymes HDAC. On pense que le groupe cap interagit avec la surface de l'enzyme et peut conférer une sélectivité en exploitant les différences dans les domaines extérieurs de l'enzyme. Le linker relie le groupe cap au ZBG et est conçu pour occuper l'espace à l'intérieur du site actif tubulaire de l'enzyme.
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