CHD6 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-413570

Panoramica

CHD6 (chromodomain helicase DNA-binding protein 6) è un rimodellatore della cromatina ATP-dipendente della famiglia CHD che accoppia il riconoscimento dei segni istonici al riposizionamento dei nucleosomi per regolare i programmi trascrizionali. Contribuisce all’organizzazione della cromatina e ai processi basati su stampo di DNA, influenzando l’espressione genica dipendente dalla RNA polimerasi II e le risposte cellulari allo stress attraverso la modulazione dell’accessibilità della cromatina. Modellando gli stati epigenetici, CHD6 incide su vie che controllano differenziamento, proliferazione e stabilità del genoma. Un rimodellamento della cromatina deregolato che coinvolge CHD6 è stato associato a reti trascrizionali alterate osservate nel cancro e in altri disturbi con disfunzione epigenetica, rendendolo un bersaglio utile per studi meccanicistici.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO CHD6 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene CHD6 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del CHD6 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto CHD6 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina CHD6.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di CHD6 per lo studio della segnalazione di CHD6, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni CHD6 critici per la funzione di CHD6
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di CHD6 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal CHD6 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal CHD6 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus CHD6. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal CHD6 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR CHD6 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia CHD6 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio CHD6 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.