Plasmide CRISPR/Cas9 KO CGGBP1 (h): sc-407049

Présentation

CGGBP1 (protéine 1 se liant aux répétitions de triplets CGG) est un facteur nucléaire de liaison à l’ADN impliqué dans la régulation de la transcription et le maintien de la stabilité du génome via des interactions avec des régions génomiques riches en séquences répétées. Il a été associé au contrôle de la progression du cycle cellulaire, à des processus liés à la chromatine et aux réponses cellulaires au stress de réplication, favorisant une réplication de l’ADN ordonnée et la fidélité de la mitose. L’activité de CGGBP1 est fréquemment étudiée dans le contexte de la régulation épigénétique et des voies de signalisation des dommages à l’ADN qui modulent la prolifération cellulaire et l’adaptation au stress. Une expression ou une fonction altérée de CGGBP1 a été associée à des phénotypes de croissance dérégulés et à des caractéristiques pertinentes pour la biologie des cancers, notamment des programmes transcriptionnels aberrants et une instabilité génomique.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO CGGBP1 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène CGGBP1 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du CGGBP1, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert CGGBP1 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine CGGBP1.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en CGGBP1 pour l'étude de la signalisation de CGGBP1, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de CGGBP1 essentiels à la fonction de CGGBP1
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de CGGBP1 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le CGGBP1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le CGGBP1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus CGGBP1. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le CGGBP1 plasmide HDR (h) et le CGGBP1 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie CGGBP1 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles CGGBP1 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.