ZNF397阻害剤は、ジンクフィンガータンパク質397(ZNF397)を標的とする特殊な分子群であり、ジンクフィンガーモチーフ-DNA、RNA、あるいは他のタンパク質との結合を可能にする、1つ以上の亜鉛イオンによって安定化された小さな機能ドメイン-によって特徴づけられるジンクフィンガータンパク質ファミリーのメンバーである。ZNF397は、他のジンクフィンガータンパク質と同様に、転写調節、DNA認識、修復、その他様々な細胞内プロセスに関与していると考えられている。ZNF397の阻害剤は、このタンパク質と特異的に相互作用し、その正常な機能を阻害するように設計されている。阻害作用は、ジンクフィンガードメインが標的分子と相互作用するのを妨害する、あるいは、タンパク質が二量体化したり、他の必須補因子と会合したりするのを妨害し、それによって細胞内での役割を阻害するといった、様々なメカニズムによって起こる可能性がある。
ZNF397阻害剤の同定と開発には、タンパク質の構造と機能を包括的に理解することが必要である。探索プロセスは、ZNF397に対して阻害活性を示す化合物を同定するためのハイスループットスクリーニング技術から始まることが多い。最初のヒットに続いて、これらの化合物が分子レベルでタンパク質とどのように相互作用するかを理解するために、計算モデリングと医薬品化学の組み合わせが採用される。研究者たちは、X線結晶構造解析や核磁気共鳴(NMR)分光法のような構造生物学的ツールを用いて、ZNF397の3次元構造、特にジンクフィンガードメインの配置を決定する。この構造的な洞察は、阻害剤の合理的な設計に不可欠であり、低分子がどのように効果的に結合し、亜鉛フィンガーモチーフのコンフォメーションや機能を変化させるかを予測することができるからである。その後、化合物の合成、in vitro試験、構造解析を繰り返しながら、これらのリード化合物を改良し、ZNF397に対する選択性と効力を向上させる一方、他のジンクフィンガータンパク質や関連性のない標的に対する親和性を低下させる。
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| 製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
|---|---|---|---|---|---|---|
5-Azacytidine | 320-67-2 | sc-221003 | 500 mg | $280.00 | 4 | |
DNAメチル化パターンを破壊することができるDNAメチル化酵素阻害剤で、ZNF397のようなジンクフィンガータンパク質のDNA結合能に影響を与える可能性がある。 | ||||||
5-Aza-2′-Deoxycytidine | 2353-33-5 | sc-202424 sc-202424A sc-202424B | 25 mg 100 mg 250 mg | $214.00 $316.00 $418.00 | 7 | |
もう一つのDNAメチル化酵素阻害剤;DNAメチル化を調節することにより、ZNF397のようなタンパク質のDNA結合特性に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Disulfiram | 97-77-8 | sc-205654 sc-205654A | 50 g 100 g | $52.00 $87.00 | 7 | |
プロテアソームを阻害し、タンパク質-タンパク質相互作用を破壊し、ZNF397の相互作用に影響を与える可能性がある。 | ||||||
MG-132 [Z-Leu- Leu-Leu-CHO] | 133407-82-6 | sc-201270 sc-201270A sc-201270B | 5 mg 25 mg 100 mg | $56.00 $260.00 $980.00 | 163 | |
プロテアソーム阻害剤は、タンパク質のターンオーバーを変化させ、ZNF397のようなタンパク質の安定性や相互作用に影響を与えることができる。 | ||||||
17-DMAG, Hydrochloride Salt | 467214-21-7 | sc-396751 | 25 mg | $306.00 | ||
Hsp90阻害剤で、タンパク質のフォールディングや相互作用を阻害し、ZNF397の機能性や安定性に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Geldanamycin | 30562-34-6 | sc-200617B sc-200617C sc-200617 sc-200617A | 100 µg 500 µg 1 mg 5 mg | $38.00 $58.00 $102.00 $202.00 | 8 | |
もう一つのHsp90阻害剤で、タンパク質の安定性と細胞内でのZNF397の相互作用に影響を与える可能性がある。 | ||||||
(±)-JQ1 | 1268524-69-1 | sc-472932 sc-472932A | 5 mg 25 mg | $226.00 $846.00 | 1 | |
ブロモドメインを標的とし、タンパク質-DNA相互作用を破壊する。これはZNF397のようなタンパク質の転写調節活性に影響を与える可能性がある。 | ||||||
I-BET 151 Hydrochloride | 1300031-49-5 (non HCl Salt) | sc-391115 | 10 mg | $450.00 | 2 | |
もう一つのブロモドメイン阻害剤は、タンパク質-DNA相互作用に影響を与え、ZNF397の転写の役割に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Nutlin-3 | 548472-68-0 | sc-45061 sc-45061A sc-45061B | 1 mg 5 mg 25 mg | $56.00 $212.00 $764.00 | 24 | |
p53-MDM2相互作用を阻害する;直接的ではないが、p53経路の調節はZNF397のような他の転写調節因子に影響を与えうる。 | ||||||
p53 Activator III, RITA | 213261-59-7 | sc-202753 sc-202753A sc-202753B sc-202753C | 1 mg 10 mg 100 mg 500 mg | $110.00 $268.00 $1533.00 $5103.00 | 9 | |
p53-HDM2の相互作用を阻害し、p53の活性化につながり、間接的にZNF397のような他のタンパク質の役割や相互作用に影響を与える可能性がある。 | ||||||