PCDHA3阻害剤

一般的なPCDHA3阻害剤には、5-Azacytidine CAS 320-67-2、Suberoylanilide Hydroxamic Acid CAS 149647-78-9 、RG 108 CAS 48208-26-0、トリコスタチン A CAS 58880-19-6、ミスラマイシン A CAS 18378-89-7などがある。

PCDHA3阻害剤は、プロトカドヘリンα遺伝子群によってコードされるタンパク質であるPCDHA3の機能を特異的に阻害するために開発された、ニッチなカテゴリーに属する化学物質です。 PCDHA3を含むプロトカドヘリンはカドヘリンスーパーファミリーに不可欠であり、特に神経系において、シナプスネットワークや神経回路網の形成に不可欠な、カルシウム依存性の細胞間接着を媒介する上で重要な役割を果たしています。PCDHA3は、ホモフィリック結合相互作用を促進するユニークな細胞外カドヘリンドメインのセットによって区別されます。この結合は、細胞接着と細胞連結におけるタンパク質の役割の中心となります。PCDHA3の阻害剤は、結合部位を直接遮断するか、タンパク質の類似体に対する親和性を低下させる構造変化を誘発することによって、このホモフィリック相互作用を妨害するように設計されています。このような阻害剤の開発には、PCDHA3の構造と、他の細胞表面分子との相互作用における分子動力学に関する複雑な知識が必要となります。 PCDHA3阻害剤の発見プロセスは、PCDHA3の機能を妨害できる分子を特定するための化合物ライブラリーのスクリーニングから始まります。 このスクリーニングでは、PCDHA3が媒介する細胞間接着を模倣する、さまざまな生化学的および細胞ベースのアッセイが用いられます。これらのアッセイは、PCDHA3の機能が効果的に阻害されたことを示す接着の減少を検出するように設計されています。これらのスクリーニングで発見された初期のヒット化合物は、通常、プロトカドヘリンファミリーの他のメンバーや異なるタイプの細胞接着分子を無差別に標的としていないことを確認するために、その特異性を検証するさらなる試験が行われます。競合結合アッセイなどの技術では、化合物が PCDHA3 の天然の結合パートナーと競合する能力をテストし、表面プラズモン共鳴のような生物物理学的手法を用いて、これらの潜在的な阻害剤と PCDHA3 の相互作用を解明します。