PCDHA1阻害剤

一般的なPCDHA1阻害剤には、トリコスタチンA CAS 58880-19-6、5-アザシチジン CAS 320-67-2、RG 108 CAS 48208-26-0、ヒドロキサム酸スベロイルアニリド CAS 149647-78-9、ミスラマイシンA CAS 18378-89-7などがある。

PCDHA1阻害剤は、カドヘリン・スーパーファミリーのサブセットであるプロトカドヘリンα遺伝子クラスターに属するPCDHA1遺伝子によってコードされるタンパク質と相互作用し、その活性を阻害する分子群を指す。プロトカドヘリンは、主に神経系に発現する細胞接着分子で、適切な神経回路形成に重要な、特定の細胞間結合の確立と維持に関与している。PCDHA1の機能は、他のプロトカドヘリンと同様、ホモフィリック細胞間相互作用を仲介することであり、これは隣接する細胞表面の同一分子間の相互作用である。PCDHA1の阻害剤は、その接着機能を破壊するような形でタンパク質に結合し、細胞間接着を効果的に媒介することを妨げる。このような阻害剤の設計と同定は複雑な作業であり、タンパク質の構造、他の細胞表面タンパク質との相互作用の性質、細胞接着に寄与する正確なメカニズムを深く理解する必要がある。

PCDHA1阻害剤の同定には、通常、PCDHA1を介した細胞接着を阻害する能力について、化合物の大規模なライブラリーを試験するハイスループットスクリーニング（HTS）が必要である。これは、PCDHA1によって促進される細胞間相互作用をシミュレートする様々なin vitroアッセイによって観察することができる。これらのスクリーニングから得られる最初のヒットは、タンパク質間相互作用を阻害する可能性を示す分子であろう。これらのリード化合物は、プロトカドヘリンファミリーの他のメンバーや他の細胞接着分子に非選択的に干渉しないことを確認しながら、その特異性をさらに評価する。阻害剤とPCDHA1間の相互作用を特徴づけるために、結合親和性研究や競合アッセイを含む詳細な生化学的・生物物理学的分析が採用されるであろう。さらに、分子レベルでの相互作用の正確な様式を解明するために、X線結晶構造解析やクライオ電子顕微鏡などの構造研究が用いられるかもしれない。