NKG2の化学的阻害剤は、免疫系におけるナチュラルキラー(NK)細胞の活性化と機能に不可欠な経路を選択的に標的とすることができる。シクロスポリンAとFK-506(タクロリムス)は、T細胞の活性化に重要なカルシニューリン経路を標的とする阻害剤である。T細胞はNK細胞とは異なるが、T細胞の活性化が低下すると、間接的にNK細胞を含む免疫系全体の活性が低下し、NKG2の機能が低下する。同様に、ラパマイシン(シロリムス)はFKBP12と複合体を形成し、細胞周期の進行と増殖に不可欠なmTOR経路を阻害する。mTORの阻害はNK細胞の活性化閾値の低下と関連しており、その結果NKG2の機能的活性が阻害される。
PD98059やU0126のような化学阻害剤は、MEK酵素を阻害し、MAPK/ERK経路の抑制につながる。この経路の阻害は、NK細胞を介する機能の低下につながる。他の2つの阻害剤、SB 203580とSP600125は、それぞれp38 MAPK経路とJNK経路を阻害し、どちらもNK細胞を含む免疫細胞の活性化と機能に関与している。これらの経路を阻害することにより、SB 203580とSP600125はNK細胞の活性を低下させ、NKG2を機能的に阻害する。さらに、LY294002やWortmanninなどのPI3K阻害剤は、NK細胞の機能に極めて重要なシグナル伝達機構を抑制し、NKG2活性を低下させる。NK細胞内の受容体シグナル伝達に不可欠なSrcファミリーキナーゼは、PP2やダサチニブが標的とする。これらの阻害剤はNK細胞の活性化を妨げ、NKG2に関連する細胞傷害性反応を低下させる。最後に、チロシンキナーゼ阻害剤としてのイマチニブは、NK細胞の活性化にも関連するAblキナーゼ活性を抑制し、その結果、免疫反応におけるNKG2の能力を機能的に阻害する。
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