NELF阻害剤は、RNAポリメラーゼII(Pol II)の休止を制御する重要な因子であるNELFの活性を調節する多様な化合物群である。これらの阻害剤は、その作用機序から直接阻害剤と間接阻害剤に分類することができる。Triptolide、Flavopiridol、DRB、THZ1などの直接阻害剤は、正転写伸長因子b(P-TEFb)複合体の構成要素、特にCDK9を標的として作用する。例えばトリプトリドは、P-TEFbの触媒サブユニットに結合することでRNAポリメラーゼIIの休止を阻害し、Pol IIをプロモーター近位の休止から解放して転写伸長を促進する。同様に、フラボピリドールはCDK9活性を阻害することでNELFを阻害し、Pol IIのリン酸化を防ぎ、転写伸長を促進する。
アクチノマイシンD、α-アマニチン、JQ1、C646のような間接的阻害剤は、転写に関連する様々な細胞プロセスに影響を与えることによってその効果を発揮する。アクチノマイシンDとアルファ-アマニチンは、それぞれDNAまたはRNAポリメラーゼIIに結合することによって転写の開始を阻害し、Pol IIのリクルートを減少させ、NELFが介在する休止を妨げる。一方、JQ1はBRD4を標的として間接的にNELFを阻害し、スーパーエロンゲーションコンプレックス(SEC)の形成を阻害し、クロマチンへのSECのリクルートを妨げる。最後に、C646はp300/CBPのヒストンアセチルトランスフェラーゼ(HAT)活性を標的とすることによって間接的にNELFを阻害し、クロマチンアクセシビリティを変化させ、標的遺伝子上の休止複合体の形成を減少させる。さらに、カンプトテシンやI-BET151のような化合物は、それぞれDNA損傷応答経路やSEC形成の阻害を介して間接的な阻害を示し、NELFを介した休止に影響を与える。まとめると、NELF阻害剤の化学的クラスは、RNAポリメラーゼIIの休止と伸長のダイナミクスを直接的または間接的に調節する、異なる作用機序を持つ様々な化合物を包含している。NELFとその阻害剤が関与する複雑な制御ネットワークを理解することは、転写調節異常が関与する病態に対する潜在的な戦略への貴重な洞察を提供する。
| 製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
|---|---|---|---|---|---|---|
Triptolide | 38748-32-2 | sc-200122 sc-200122A | 1 mg 5 mg | $88.00 $200.00 | 13 | |
トリプトリドは、RNAポリメラーゼII(Pol II)の一時停止を妨害することで、NELFを直接阻害する。これは、P-TEFb複合体の触媒サブユニットに結合し、プロモーター近傍の一時停止からPol IIを解放する。この直接阻害により転写伸長が促進され、NELFによるPol IIの一時停止が妨げられる。 | ||||||
Flavopiridol | 146426-40-6 | sc-202157 sc-202157A | 5 mg 25 mg | $78.00 $254.00 | 41 | |
フラボピリドールは、P-TEFb複合体内のCDK9を標的として、NELFを直接阻害する。CDK9の活性を阻害することで、フラボピリドールはPol IIのリン酸化を防ぎ、NELF媒介のポージングを阻害する。この直接的な阻害により、ポージング複合体からのPol IIの放出が促進され、効率的な転写伸長が促進される。 | ||||||
DRB | 53-85-0 | sc-200581 sc-200581A sc-200581B sc-200581C | 10 mg 50 mg 100 mg 250 mg | $42.00 $185.00 $310.00 $650.00 | 6 | |
DRBは、P-TEFb複合体のCDK9の機能を阻害することで、NELFを直接阻害する。CDK9を阻害することで、DRBはPol IIのリン酸化を阻害し、NELF媒介のポージングを妨害する。この直接的な阻害により、ポージングから伸長中のPol IIへの移行が促進され、転写活性が容易になる。 | ||||||
THZ1 | 1604810-83-4 | sc-507542 | 1 mg | $95.00 | ||
THZ1は、P-TEFb複合体の構成要素であるCDK7を標的として、NELFを直接阻害する。CDK7を阻害することで、THZ1はPol IIのリン酸化を妨害し、NELF媒介のポージングを防ぐ。この直接的な阻害により、Pol IIはプロモーター近傍領域から遊離しやすくなり、転写伸長が促進され、ポージングが妨げられる。 | ||||||
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
アクチノマイシンDは、DNAに挿入して転写開始を妨げることで、間接的にNELFを阻害する。DNA鋳型に結合することで、アクチノマイシンDは転写装置の組み立てを妨げ、Pol IIのリクルートメントを減少させる。この間接的な阻害により、転写開始が制限され、NELF媒介のポーズが妨げられる。 | ||||||
α-Amanitin | 23109-05-9 | sc-202440 sc-202440A | 1 mg 5 mg | $260.00 $1029.00 | 26 | |
α-アマニチンは、転写伸長期のRNAポリメラーゼII(Pol II)を選択的に阻害することで、間接的にNELFを阻害する。Pol II酵素に結合することで、α-アマニチンは伸長プロセスを停止させ、NELFによる一時停止を妨げる。この間接的な阻害により、正常な転写サイクルが中断され、一時停止が減少し、伸長が促進される。 | ||||||
(±)-JQ1 | 1268524-69-1 | sc-472932 sc-472932A | 5 mg 25 mg | $226.00 $846.00 | 1 | |
JQ1 は BRD4 を標的とし、スーパー伸長複合体(SEC)の形成を阻害することで、間接的に NELF を阻害する。JQ1 は BRD4 を阻害することで、SEC のクロマチンへの結合を阻害し、NELF 媒介のポージングを阻害する。この間接的な阻害により、標的遺伝子上のポージング複合体の形成が阻害され、転写伸長が促進される。 | ||||||
Camptothecin | 7689-03-4 | sc-200871 sc-200871A sc-200871B | 50 mg 250 mg 100 mg | $57.00 $182.00 $92.00 | 21 | |
カンプトテシンは、DNA損傷を誘発し、DNA損傷応答経路を活性化することで、NELFを間接的に阻害する。これらの経路の活性化は転写開始の阻害につながり、NELFが媒介する一時停止を妨げる。この間接的な阻害は、正常な転写サイクルを崩壊させ、標的遺伝子における一時停止複合体の形成を減少させる。 | ||||||
C646 | 328968-36-1 | sc-364452 sc-364452A | 10 mg 50 mg | $260.00 $925.00 | 5 | |
C646は、p300/CBPのヒストンアセチルトランスフェラーゼ(HAT)活性を標的とすることで、NELFを間接的に阻害する。p300/CBPを阻害することで、C646はクロマチンのアクセス可能性を変化させ、NELF媒介のポージングを防ぐ。この間接的な阻害は、エピジェネティックなランドスケープに影響を与え、標的遺伝子におけるポージング複合体の形成を減少させることで、転写伸長を促進する。 | ||||||
I-BET 151 Hydrochloride | 1300031-49-5 (non HCl Salt) | sc-391115 | 10 mg | $450.00 | 2 | |
I-BET151はBRD4を標的とし、スーパー伸長複合体(SEC)の形成を阻害することで、間接的にNELFを阻害する。BRD4を阻害することで、I-BET151はSECのクロマチンへの結合を阻害し、NELF媒介のポージングを阻害する。この間接的な阻害により、標的遺伝子におけるポージング複合体の形成が阻害され、転写伸長が促進される。 | ||||||