MBD3L2-5活性化因子には、直接的または間接的にMBD3L2-5タンパク質の活性を調節する一連の分子が含まれる。これらのタンパク質はMBDファミリーに属し、メチル化DNAを認識すると仮定されている。これらのタンパク質に対する直接的な化学的活性化因子が存在しないことから、MBD3L2-5の活性と基質結合を間接的に調節しうる、ゲノムのメチル化ランドスケープに影響を与える分子に焦点が移る。5-アザシチジンとデシタビンはシチジン類似体であり、その主なメカニズムはDNAに取り込まれ、DNAメチルトランスフェラーゼを捕捉することによって脱メチル化につながることである。その結果、DNAのメチル化プロファイルが変化し、MBD3L2-5の結合部位が増加する。この作用と同様に、ゼブラリンもDNAに取り込まれ、その後の脱メチル化につながり、MBD3L2-5の基質相互作用に影響を与える。
非ヌクレオシド系では、RG108、プロカインアミド、ジスルフィラム、ナナオマイシンAがDNAメチル化酵素を標的とする分子として注目されている。これらの酵素を阻害することにより、これらの化合物はメチル化のランドスケープを再構築し、MBD3L2-5が結合するメチル化DNA基質の利用可能性を高める。特に、RG108の作用機序は、DNAに取り込まれることなくDNMTを選択的に阻害するユニークな方法であり、ヌクレオシドアナログとは異なる特徴を持っている。3-ジアザネプラノシンAは、主にヒストンメチルトランスフェラーゼであるが、DNAメチル化において間接的な役割を果たしている。ヒストンのメチル化に対するその作用は波及効果を引き起こし、DNAのメチル化動態に影響を与え、その結果、MBD3L2-5の活性にも影響を与える。同様に、BIX-01294はG9aヒストンメチル化酵素でありながら、DNAメチル化に二次的な影響を及ぼし、DNAとヒストンメチル化の間の絡み合った関係を示している。結論として、今回紹介した化学物質は、DNAのメチル化を調節し、MBD3L2-5タンパク質の基質利用可能性と活性に影響を与える手段を提供する。これらの活性化剤は、DNAメチル化酵素を直接阻害するか、あるいはDNAメチル化ダイナミクスに二次的な影響を与えることにより、メチル化DNAを認識するMBD3L2-5の役割に影響を与えるメカニズムについての洞察を与えてくれる。
関連項目
| 製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
|---|---|---|---|---|---|---|
5-Azacytidine | 320-67-2 | sc-221003 | 500 mg | $280.00 | 4 | |
DNAメチル化酵素を捕捉することによってDNAの脱メチル化を引き起こすシチジン類似体。これにより、MBD3L2-5が結合するメチル化DNA基質のプールを増加させることができる。 | ||||||
RG 108 | 48208-26-0 | sc-204235 sc-204235A | 10 mg 50 mg | $131.00 $515.00 | 2 | |
DNAメチル化酵素の非ヌクレオシド阻害剤。メチル化状態を変化させることで、MBD3L2-5の基質利用性を変化させる可能性がある。 | ||||||
Zebularine | 3690-10-6 | sc-203315 sc-203315A sc-203315B | 10 mg 25 mg 100 mg | $129.00 $284.00 $1004.00 | 3 | |
DNAに取り込まれ、脱メチル化を引き起こすシチジン類似体。MBD3L2-5の相互作用に影響を与える可能性がある。 | ||||||
SGI-1027 | 1020149-73-8 | sc-473875 | 10 mg | $213.00 | ||
DNAメチル化酵素DNMT1、DNMT3A、DNMT3Bを阻害し、MBD3L2-5のサイトを増加させる可能性がある。 | ||||||
Procainamide hydrochloride | 614-39-1 | sc-202297 | 10 g | $53.00 | ||
非ヌクレオシド系DNMT阻害剤で、DNAメチル化の状況を再構築し、間接的にMBD3L2-5の基質結合に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Histone Lysine Methyltransferase Inhibitor 抑制剤 | 935693-62-2 (free base) | sc-202651 | 5 mg | $151.00 | 4 | |
主にG9aヒストン・メチルトランスフェラーゼを標的とするが、DNAメチル化に二次的な影響を及ぼし、MBD3L2-5の活性に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
1-Hydrazinophthalazine Hydrochloride | 304-20-1 | sc-206167 | 10 g | $280.00 | ||
DNMTを標的としてDNAのメチル化を抑制する。メチル化状態の変化はMBD3L2-5の結合動態に影響を与える。 | ||||||