Histone cluster 1 H2B アクチベーター

一般的なヒストンクラスター1 H2B 活性化剤には、トリコスタチン A CAS 58880-19-6、ナトリウム ブチレート CAS 156-54-7、Suberoylanilide ヒドロキサム酸 CAS 149647-78-9、Panobinostat CAS 404950-80-7、およびバルプロ酸 CAS 99-66-1などがあるが、これらに限定されるものではない。 oylanilide Hydroxamic Acid CAS 149647-78-9、Panobinostat CAS 404950-80-7、Valproic Acid CAS 99-66-1などがある。

ヒストンクラスター1 H2Bの化学的活性化剤は、主にヒストン脱アセチル化酵素（HDAC）を阻害することによって作用する。HDACはヒストン蛋白質からアセチル基を除去する酵素であり、クロマチン構造をよりコンパクトにし、転写活性を低下させる。トリコスタチンA、酪酸ナトリウム、ボリノスタット、パノビノスタット、バルプロ酸、ロミデプシン、ベリノスタット、エンチノスタット、タセジナリン、ジビノスタット、モセチノスタット、チダミドなどの活性化剤は、ヒストンクラスター1 H2Bの脱アセチル化を阻害するという点で作用機序が共通している。この阻害作用により、ヒストン上にアセチル化マークが蓄積する。ヒストンクラスター1 H2Bのアセチル化が進むと、ヒストンとDNAの相互作用が変化し、結合が弱まり、クロマチンの凝縮が弱まる。このようにクロマチン構造が緩やかになると、転写装置がDNAにアクセスしやすくなり、ヒストンクラスター1 H2Bが関与する転写過程の活性化が可能になる。

それぞれの化学活性化剤は、この基本的なメカニズムを共有しながらも、HDACとの相互作用において特異性を示すことができる。例えば、トリコスタチンAやボリノスタットは広範なHDAC阻害剤であり、幅広いHDAC酵素に作用する。エンチノスタットのように、クラスIのHDACに対して選択性を示すものもある。この選択性は、ヒストンクラスター1のH2Bのアセチル化の程度と特異的部位に影響を与える可能性がある。これらの阻害剤の作用によってもたらされるアセチル化マークは、転写制御に関与する他のタンパク質をリクルートするシグナルとして機能し、転写活性化をさらに促進する。これらの活性化剤によって導入されるアセチル化の正確なパターンは、結果として発現される特定の遺伝子を決定することができる。総合すると、これらの化学的活性化因子は、転写機構がアクセスしやすいクロマチン環境を促進することによって、ヒストンクラスター1 H2Bを遺伝子発現に適した活性状態に移行させる。