YTHDF1 Inibitori

I comuni inibitori di YTHDF1 includono, a titolo esemplificativo, l'acido aurintricarbossilico CAS 4431-00-9, il blu di metilene CAS 61-73-4, la clorochina CAS 54-05-7, l'emetina CAS 483-18-1 e la daunorubicina cloridrato CAS 23541-50-6.

Gli inibitori chimici di YTHDF1 interferiscono con la sua capacità di legarsi all'RNA m6A-modificato, un aspetto cruciale della sua funzione nel metabolismo dell'RNA. La rodamina 6G, il blu di metilene, la clorochina, la daunorubicina, la doxorubicina e l'ellittica agiscono attraverso un meccanismo di intercalazione nell'RNA. Questa intercalazione probabilmente ostruisce i siti di legame sull'RNA, impedendo a YTHDF1 di accedere ai suoi bersagli. Lo ioduro di propidio condivide una modalità d'azione simile, inserendosi nella struttura dell'RNA e potenzialmente competendo con YTHDF1 per l'interazione con i siti m6A. D'altra parte, l'Eriochrome Black T utilizza un approccio diverso, chelando gli ioni metallici, che sono vitali per l'integrità strutturale e la funzione di YTHDF1, impedendo così la sua capacità di legare l'RNA.

L'acido aurintricarbossilico agisce bloccando l'interazione tra acidi nucleici e proteine, inibendo così il legame di YTHDF1 ai siti m6A sull'RNA. L'emetina adotta una strategia inibitoria diversa, legandosi all'RNA ribosomiale, che può causare ostacoli sterici o indurre cambiamenti conformazionali nell'RNA ribosomiale, con conseguente riduzione dell'interazione tra YTHDF1 e i suoi bersagli di RNA modificati con m6A. Il mitoxantrone condivide un meccanismo simile a quello degli agenti intercalanti, ma si distingue per la sua struttura chimica. L'actinomicina D, pur non ostacolando direttamente la funzione di YTHDF1, si lega al DNA e ostacola la trascrizione dell'RNA, che a sua volta potrebbe ridurre la disponibilità complessiva di RNA per il legame con YTHDF1. Ciascuna di queste sostanze chimiche, attraverso le rispettive modalità d'azione, interrompe la normale funzione di YTHDF1 nell'elaborazione delle molecole di RNA modificate con m6A.