DDX19B Inibitori

Gli inibitori DDX19B comuni includono, ma non solo, Novobiocin CAS 303-81-1, Acido Aurintricarbossilico CAS 4431-00-9, Etidio bromuro CAS 1239-45-8, Berberina CAS 2086-83-1 e Amsacrina cloridrato CAS 54301-15-4.

Gli inibitori chimici di DDX19B mirano alle funzioni essenziali della proteina, come l'idrolisi dell'ATP e il legame con l'RNA, che sono fondamentali per la sua attività di elicasi coinvolta nel trasporto nucleocitoplasmatico dell'RNA. La novobiocina svolge una funzione simile legandosi al dominio ATPasi di DDX19B, impedendo così i cambiamenti conformazionali necessari per la sua funzione di elicasi dell'RNA. L'acido aurintricarbossilico inibisce DDX19B ostacolando l'interazione tra la proteina e l'RNA, poiché si lega ai siti di legame dell'acido nucleico di DDX19B, impedendo alla proteina di svolgere la sua funzione di srotolamento dell'RNA. L'interferenza con le strutture degli acidi nucleici è un'altra strategia impiegata da inibitori come il bromuro di etidio e la berberina; questi composti si intercalano con gli acidi nucleici, alterandone la struttura e quindi inibendo la capacità di DDX19B di legare o srotolare il suo substrato.

Altre sostanze chimiche, come l'amsacrina e il mitoxantrone, disturbano la funzione di DDX19B con mezzi simili. Inserendosi nel DNA, creano una struttura distorta dell'acido nucleico con cui DDX19B non può impegnarsi efficacemente, ostacolando così la sua azione di elicasi. L'actinomicina D si lega al DNA e ostacola la sintesi di RNA DNA-dipendente, determinando l'inibizione di DDX19B per ostacolo sterico, impedendo alla proteina di interagire con il suo substrato RNA. La suramina e l'eparina inibiscono la DDX19B con un meccanismo diverso: si legano alla proteina e ne ostacolano l'interazione con i substrati di RNA, essenziale per la sua attività di elicasi. L'oxaliplatino forma addotti e legami incrociati con il DNA che non vengono facilmente sciolti da DDX19B, con conseguente inibizione dell'attività elicasica della proteina. Infine, la daunorubicina, attraverso la sua intercalazione nel DNA, impedisce l'azione di srotolamento di DDX19B, inibendo così il ruolo della proteina nel trasporto nucleocitoplasmatico dell'RNA.