Inhibiteurs Pex5p

Les inhibiteurs courants de Pex5p comprennent, entre autres, la thioridazine CAS 50-52-2, le clofibrate CAS 637-07-0, le fénofibrate CAS 49562-28-9, la rosiglitazone CAS 122320-73-4 et le bézafibrate CAS 41859-67-0.

Les inhibiteurs de Pex5p sont une catégorie de composés chimiques spécifiquement conçus pour cibler et inhiber la fonction de la protéine Pex5p, qui sert de récepteur cytosolique aux protéines contenant le signal de ciblage peroxysomal de type 1 (PTS1), facilitant leur transport dans les peroxysomes. Cette protéine joue un rôle crucial dans la biogenèse des peroxysomes, organites essentiels à divers processus métaboliques, notamment la bêta-oxydation des acides gras et la détoxification du peroxyde d'hydrogène. Le développement d'inhibiteurs de Pex5p implique un processus complexe qui commence par une compréhension détaillée de la structure de la protéine Pex5p et de son interaction avec les protéines contenant le PTS1. Des techniques avancées de biologie structurale, telles que la cristallographie aux rayons X et la spectroscopie de résonance magnétique nucléaire (RMN), sont utilisées pour élucider la structure tridimensionnelle de la Pex5p, révélant ainsi les sites de liaison potentiels pour les inhibiteurs. Ensuite, des chimiothèques sont passées au crible pour trouver des composés capables de se lier à ces sites, en utilisant des essais de criblage à haut débit pour identifier les molécules qui inhibent efficacement l'interaction Pex5p-PTS1.

Après l'identification des inhibiteurs potentiels de Pex5p, l'accent est mis sur l'optimisation de ces composés afin d'améliorer leur spécificité, leur puissance et leur effet inhibiteur global sur Pex5p. Ce processus d'optimisation repose sur des études de relations structure-activité (SAR), dans lesquelles des modifications chimiques sont systématiquement apportées aux structures des composés initiaux. Ces modifications visent à améliorer l'affinité des composés pour Pex5p et leur capacité à perturber l'interaction Pex5p-PTS1, inhibant ainsi le transport des protéines contenant PTS1 dans les peroxysomes. Les techniques de modélisation informatique, y compris l'amarrage moléculaire et les simulations dynamiques, jouent un rôle important dans la prévision des effets de ces modifications sur l'interaction entre les inhibiteurs de Pex5p et la protéine cible. La validation empirique de ces prédictions est réalisée par des essais biochimiques, qui mesurent l'activité inhibitrice des composés modifiés contre Pex5p.