Inhibiteurs DDX10

Les inhibiteurs courants de DDX10 comprennent, entre autres, l'acide aurintricarboxylique CAS 4431-00-9, le bromure d'éthidium CAS 1239-45-8, l'héparine CAS 9005-49-6, la novobiocine CAS 303-81-1 et la berbérine CAS 2086-83-1.

Les inhibiteurs chimiques de DDX10 utilisent divers mécanismes pour inhiber l'activité hélicase de cette protéine. La novobiocine cible le domaine ATPase de la DDX10, entravant la liaison de l'ATP et l'activité hélicase qui s'ensuit. La suramine, en interagissant avec les nucléotides et les acides nucléiques, peut inhiber DDX10 en perturbant la capacité de l'enzyme à hydrolyser l'ATP. L'acide aurintricarboxylique inhibe l'interaction entre DDX10 et son substrat ARN en se liant aux sites de liaison de l'acide nucléique sur DDX10, incapacitant ainsi l'interaction fonctionnelle de la protéine avec l'ARN.

Le bromure d'éthidium, la berbérine, l'amsacrine, la daunorubicine, la mitoxantrone et l'actinomycine D agissent tous en interférant avec les acides nucléiques avec lesquels DDX10 est censé interagir. Le bromure d'éthidium et la berbérine s'intercalent dans les acides nucléiques et modifient la structure de l'ARN ou de l'ADN, ce qui empêche DDX10 de lier ou de dérouler son substrat. Cette altération structurelle des acides nucléiques par les agents intercalants constitue un obstacle à l'activité hélicase de DDX10. L'oxaliplatine forme des adduits à l'ADN, créant des liaisons transversales au sein de l'ADN qui sont insurmontables par la fonction hélicase de DDX10, inhibant ainsi son activité. L'actinomycine D se lie à l'ADN et bloque les sites de transcription et d'interaction, les rendant inaccessibles à DDX10, empêchant l'action de déroulement de l'hélicase. L'héparine, bien que principalement connue pour ses propriétés anticoagulantes, possède également la capacité de se lier aux protéines qui interagissent avec les acides nucléiques; elle peut se lier à DDX10 et empêcher stériquement la protéine de s'engager avec ses substrats d'acide nucléique, inhibant ainsi l'activité de l'hélicase.