Inhibiteurs APOBEC4

Les inhibiteurs courants de l'APOBEC4 comprennent notamment la Quinomycine A CAS 512-64-1, l'Acide Aurintricarboxylique CAS 4431-00-9, la 2-Chloro-2′-désoxyadénosine CAS 4291-63-8, le GW6471 CAS 880635-03-0 et le Ténofovir CAS 147127-20-6.

Les inhibiteurs chimiques de l'APOBEC4 fonctionnent selon divers mécanismes qui interfèrent avec sa capacité à se lier aux acides nucléiques et à les modifier. L'échinomycine, un antibiotique quinoxalin, agit en s'intercalant dans les brins d'ADN, ce qui peut empêcher l'accès de l'APOBEC4 à ses substrats d'ADN simple brin, entravant ainsi son activité de désaminase. De même, l'acide aurintricarboxylique, connu pour sa capacité à inhiber les protéines de liaison aux acides nucléiques, peut empêcher l'APOBEC4 d'interagir avec les substrats d'ARN et d'ADN, ce qui conduit à l'inhibition de sa fonction d'édition. En outre, les analogues nucléosidiques tels que la cladribine et la stavudine peuvent être incorporés dans l'ADN et perturber le processus d'édition, soit en bloquant directement la reconnaissance du substrat de l'APOBEC4, soit en entrant en compétition avec les nucléotides naturels pour les sites de liaison. Le ténofovir, un autre analogue nucléotidique, peut être intégré dans les chaînes d'ADN et d'ARN et est susceptible d'exercer un effet inhibiteur similaire sur l'APOBEC4 en modifiant la structure de ses substrats.

D'autres inhibiteurs chimiques agissent en influençant l'environnement cellulaire et les voies biochimiques qui affectent l'activité de l'APOBEC4. Le GW6471, un antagoniste des PPARα, peut modifier les niveaux d'expression de diverses protéines et enzymes, réduisant potentiellement la disponibilité des substrats ou des cofacteurs nécessaires au fonctionnement de l'APOBEC4. Le léflunomide affecte la synthèse de la pyrimidine, ce qui peut réduire le pool de nucléotides pyrimidiques, essentiels à l'activité d'édition des acides nucléiques de l'APOBEC4. La zébularine et la cordycépine, deux analogues de nucléosides, peuvent inhiber l'APOBEC4 en s'incorporant aux acides nucléiques, bloquant ainsi l'activité de désamination de l'enzyme ou perturbant le traitement de l'ARN. Enfin, l'inhibition de l'orotidine-5'-phosphate décarboxylase par la pyrazofurine entraîne une diminution de la disponibilité des nucléotides, qui sont essentiels aux fonctions d'édition des acides nucléiques de l'APOBEC4.